Protein–RNA interactions for Protein: O95231

VENTX, Homeobox protein VENTX, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXO95231 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VENTXO95231 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VENTXO95231 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VENTXO95231 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VENTXO95231 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VENTXO95231 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VENTXO95231 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VENTXO95231 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VENTXO95231 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VENTXO95231 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VENTXO95231 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VENTXO95231 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VENTXO95231 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VENTXO95231 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VENTXO95231 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VENTXO95231 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VENTXO95231 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VENTXO95231 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VENTXO95231 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VENTXO95231 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VENTXO95231 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VENTXO95231 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VENTXO95231 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VENTXO95231 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VENTXO95231 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VENTXO95231 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VENTXO95231 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VENTXO95231 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VENTXO95231 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VENTXO95231 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VENTXO95231 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VENTXO95231 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VENTXO95231 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VENTXO95231 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VENTXO95231 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VENTXO95231 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VENTXO95231 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VENTXO95231 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VENTXO95231 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VENTXO95231 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VENTXO95231 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VENTXO95231 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VENTXO95231 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VENTXO95231 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VENTXO95231 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VENTXO95231 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VENTXO95231 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VENTXO95231 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VENTXO95231 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VENTXO95231 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VENTXO95231 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VENTXO95231 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VENTXO95231 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VENTXO95231 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VENTXO95231 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VENTXO95231 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VENTXO95231 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VENTXO95231 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VENTXO95231 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VENTXO95231 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VENTXO95231 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VENTXO95231 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VENTXO95231 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VENTXO95231 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VENTXO95231 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VENTXO95231 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VENTXO95231 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VENTXO95231 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VENTXO95231 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VENTXO95231 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VENTXO95231 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VENTXO95231 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VENTXO95231 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VENTXO95231 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VENTXO95231 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VENTXO95231 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VENTXO95231 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VENTXO95231 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VENTXO95231 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VENTXO95231 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VENTXO95231 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VENTXO95231 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VENTXO95231 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VENTXO95231 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VENTXO95231 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VENTXO95231 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VENTXO95231 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VENTXO95231 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VENTXO95231 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VENTXO95231 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VENTXO95231 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
VENTXO95231 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VENTXO95231 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VENTXO95231 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VENTXO95231 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VENTXO95231 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VENTXO95231 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VENTXO95231 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VENTXO95231 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VENTXO95231 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms