Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM63AO94886 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM63AO94886 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM63AO94886 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM63AO94886 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM63AO94886 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM63AO94886 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM63AO94886 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM63AO94886 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM63AO94886 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM63AO94886 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM63AO94886 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM63AO94886 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM63AO94886 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM63AO94886 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms