Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX3O75364 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX3O75364 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX3O75364 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX3O75364 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX3O75364 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX3O75364 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX3O75364 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX3O75364 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX3O75364 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX3O75364 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX3O75364 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX3O75364 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX3O75364 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX3O75364 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX3O75364 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX3O75364 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX3O75364 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX3O75364 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX3O75364 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX3O75364 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX3O75364 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX3O75364 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX3O75364 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX3O75364 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX3O75364 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX3O75364 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX3O75364 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX3O75364 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX3O75364 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX3O75364 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX3O75364 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX3O75364 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX3O75364 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX3O75364 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX3O75364 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX3O75364 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX3O75364 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX3O75364 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX3O75364 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX3O75364 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX3O75364 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX3O75364 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX3O75364 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX3O75364 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PITX3O75364 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITX3O75364 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX3O75364 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX3O75364 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX3O75364 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX3O75364 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX3O75364 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX3O75364 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX3O75364 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX3O75364 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX3O75364 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX3O75364 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX3O75364 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX3O75364 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX3O75364 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX3O75364 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX3O75364 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX3O75364 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITX3O75364 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITX3O75364 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX3O75364 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX3O75364 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX3O75364 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX3O75364 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX3O75364 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX3O75364 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX3O75364 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX3O75364 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX3O75364 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX3O75364 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX3O75364 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX3O75364 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX3O75364 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX3O75364 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX3O75364 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX3O75364 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX3O75364 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX3O75364 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX3O75364 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX3O75364 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX3O75364 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX3O75364 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX3O75364 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX3O75364 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX3O75364 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX3O75364 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX3O75364 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX3O75364 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX3O75364 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX3O75364 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX3O75364 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX3O75364 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX3O75364 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX3O75364 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PITX3O75364 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms