Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAB11FIP3O75154 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
RAB11FIP3O75154 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB11FIP3O75154 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RAB11FIP3O75154 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RAB11FIP3O75154 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAB11FIP3O75154 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAB11FIP3O75154 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAB11FIP3O75154 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB11FIP3O75154 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB11FIP3O75154 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB11FIP3O75154 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB11FIP3O75154 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB11FIP3O75154 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB11FIP3O75154 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB11FIP3O75154 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB11FIP3O75154 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB11FIP3O75154 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB11FIP3O75154 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB11FIP3O75154 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAB11FIP3O75154 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAB11FIP3O75154 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAB11FIP3O75154 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB11FIP3O75154 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAB11FIP3O75154 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAB11FIP3O75154 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RAB11FIP3O75154 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RAB11FIP3O75154 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RAB11FIP3O75154 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAB11FIP3O75154 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAB11FIP3O75154 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB11FIP3O75154 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAB11FIP3O75154 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAB11FIP3O75154 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAB11FIP3O75154 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB11FIP3O75154 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB11FIP3O75154 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAB11FIP3O75154 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB11FIP3O75154 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB11FIP3O75154 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB11FIP3O75154 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB11FIP3O75154 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB11FIP3O75154 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB11FIP3O75154 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB11FIP3O75154 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RAB11FIP3O75154 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms