Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSPNO60542 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPNO60542 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSPNO60542 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSPNO60542 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSPNO60542 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSPNO60542 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSPNO60542 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSPNO60542 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPNO60542 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSPNO60542 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSPNO60542 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSPNO60542 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSPNO60542 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSPNO60542 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSPNO60542 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPNO60542 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPNO60542 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPNO60542 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPNO60542 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPNO60542 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPNO60542 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPNO60542 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPNO60542 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPNO60542 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPNO60542 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPNO60542 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPNO60542 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPNO60542 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPNO60542 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPNO60542 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPNO60542 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPNO60542 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPNO60542 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPNO60542 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPNO60542 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPNO60542 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPNO60542 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPNO60542 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPNO60542 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPNO60542 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPNO60542 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPNO60542 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPNO60542 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPNO60542 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPNO60542 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPNO60542 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPNO60542 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPNO60542 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPNO60542 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPNO60542 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPNO60542 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPNO60542 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPNO60542 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPNO60542 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPNO60542 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPNO60542 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPNO60542 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPNO60542 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPNO60542 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPNO60542 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPNO60542 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPNO60542 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPNO60542 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPNO60542 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPNO60542 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPNO60542 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPNO60542 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPNO60542 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPNO60542 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPNO60542 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPNO60542 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPNO60542 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPNO60542 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPNO60542 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPNO60542 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPNO60542 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPNO60542 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPNO60542 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPNO60542 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPNO60542 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPNO60542 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPNO60542 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPNO60542 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPNO60542 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPNO60542 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPNO60542 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPNO60542 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPNO60542 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPNO60542 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPNO60542 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSPNO60542 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPNO60542 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPNO60542 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPNO60542 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPNO60542 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPNO60542 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPNO60542 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPNO60542 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPNO60542 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms