Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSPNO60542 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSPNO60542 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSPNO60542 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSPNO60542 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PSPNO60542 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSPNO60542 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPNO60542 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSPNO60542 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSPNO60542 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSPNO60542 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSPNO60542 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPNO60542 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSPNO60542 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSPNO60542 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPNO60542 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSPNO60542 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSPNO60542 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSPNO60542 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSPNO60542 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSPNO60542 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSPNO60542 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSPNO60542 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPNO60542 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPNO60542 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSPNO60542 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSPNO60542 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPNO60542 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPNO60542 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPNO60542 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPNO60542 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPNO60542 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPNO60542 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSPNO60542 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSPNO60542 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPNO60542 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSPNO60542 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPNO60542 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPNO60542 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPNO60542 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPNO60542 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPNO60542 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPNO60542 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPNO60542 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSPNO60542 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPNO60542 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPNO60542 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPNO60542 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPNO60542 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPNO60542 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPNO60542 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPNO60542 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPNO60542 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPNO60542 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPNO60542 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPNO60542 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPNO60542 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPNO60542 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPNO60542 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPNO60542 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPNO60542 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPNO60542 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPNO60542 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSPNO60542 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPNO60542 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPNO60542 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPNO60542 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPNO60542 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPNO60542 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPNO60542 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSPNO60542 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPNO60542 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSPNO60542 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPNO60542 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPNO60542 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPNO60542 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPNO60542 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPNO60542 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPNO60542 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPNO60542 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPNO60542 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPNO60542 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPNO60542 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPNO60542 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPNO60542 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPNO60542 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPNO60542 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPNO60542 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPNO60542 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPNO60542 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPNO60542 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPNO60542 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPNO60542 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPNO60542 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPNO60542 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPNO60542 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPNO60542 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPNO60542 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPNO60542 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPNO60542 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms