Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM1AO60341 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM1AO60341 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM1AO60341 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM1AO60341 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM1AO60341 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM1AO60341 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM1AO60341 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1AO60341 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM1AO60341 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM1AO60341 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM1AO60341 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM1AO60341 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM1AO60341 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM1AO60341 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms