Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PJA2O43164 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PJA2O43164 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PJA2O43164 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PJA2O43164 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PJA2O43164 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PJA2O43164 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PJA2O43164 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PJA2O43164 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PJA2O43164 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PJA2O43164 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PJA2O43164 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PJA2O43164 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PJA2O43164 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PJA2O43164 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PJA2O43164 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PJA2O43164 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PJA2O43164 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PJA2O43164 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PJA2O43164 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PJA2O43164 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PJA2O43164 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PJA2O43164 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PJA2O43164 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PJA2O43164 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PJA2O43164 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PJA2O43164 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PJA2O43164 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PJA2O43164 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PJA2O43164 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PJA2O43164 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PJA2O43164 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PJA2O43164 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PJA2O43164 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PJA2O43164 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PJA2O43164 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PJA2O43164 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PJA2O43164 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PJA2O43164 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PJA2O43164 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PJA2O43164 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PJA2O43164 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PJA2O43164 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PJA2O43164 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PJA2O43164 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PJA2O43164 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PJA2O43164 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PJA2O43164 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PJA2O43164 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PJA2O43164 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PJA2O43164 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PJA2O43164 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PJA2O43164 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PJA2O43164 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PJA2O43164 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PJA2O43164 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PJA2O43164 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PJA2O43164 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PJA2O43164 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PJA2O43164 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PJA2O43164 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PJA2O43164 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PJA2O43164 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PJA2O43164 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PJA2O43164 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PJA2O43164 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PJA2O43164 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PJA2O43164 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PJA2O43164 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PJA2O43164 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PJA2O43164 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PJA2O43164 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PJA2O43164 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PJA2O43164 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PJA2O43164 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PJA2O43164 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PJA2O43164 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PJA2O43164 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PJA2O43164 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PJA2O43164 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PJA2O43164 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PJA2O43164 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PJA2O43164 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PJA2O43164 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PJA2O43164 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PJA2O43164 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PJA2O43164 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PJA2O43164 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PJA2O43164 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PJA2O43164 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PJA2O43164 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PJA2O43164 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PJA2O43164 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PJA2O43164 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PJA2O43164 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PJA2O43164 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PJA2O43164 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PJA2O43164 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PJA2O43164 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PJA2O43164 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms