Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PJA2O43164 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PJA2O43164 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PJA2O43164 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PJA2O43164 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PJA2O43164 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PJA2O43164 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PJA2O43164 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PJA2O43164 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PJA2O43164 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PJA2O43164 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PJA2O43164 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PJA2O43164 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PJA2O43164 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PJA2O43164 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PJA2O43164 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PJA2O43164 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PJA2O43164 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PJA2O43164 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PJA2O43164 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PJA2O43164 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PJA2O43164 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PJA2O43164 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PJA2O43164 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PJA2O43164 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PJA2O43164 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PJA2O43164 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PJA2O43164 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PJA2O43164 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PJA2O43164 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PJA2O43164 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PJA2O43164 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PJA2O43164 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PJA2O43164 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PJA2O43164 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PJA2O43164 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PJA2O43164 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PJA2O43164 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PJA2O43164 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PJA2O43164 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PJA2O43164 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PJA2O43164 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PJA2O43164 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PJA2O43164 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PJA2O43164 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PJA2O43164 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PJA2O43164 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PJA2O43164 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PJA2O43164 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PJA2O43164 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PJA2O43164 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PJA2O43164 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PJA2O43164 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PJA2O43164 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PJA2O43164 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PJA2O43164 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PJA2O43164 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PJA2O43164 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PJA2O43164 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PJA2O43164 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PJA2O43164 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PJA2O43164 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PJA2O43164 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PJA2O43164 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PJA2O43164 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PJA2O43164 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PJA2O43164 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PJA2O43164 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PJA2O43164 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PJA2O43164 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PJA2O43164 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PJA2O43164 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PJA2O43164 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PJA2O43164 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PJA2O43164 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PJA2O43164 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PJA2O43164 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PJA2O43164 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PJA2O43164 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PJA2O43164 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PJA2O43164 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PJA2O43164 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PJA2O43164 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PJA2O43164 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PJA2O43164 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PJA2O43164 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PJA2O43164 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PJA2O43164 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PJA2O43164 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PJA2O43164 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PJA2O43164 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PJA2O43164 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PJA2O43164 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PJA2O43164 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PJA2O43164 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PJA2O43164 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PJA2O43164 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PJA2O43164 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PJA2O43164 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PJA2O43164 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms