Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB1O43157 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB1O43157 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB1O43157 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB1O43157 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB1O43157 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB1O43157 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB1O43157 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNB1O43157 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNB1O43157 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLXNB1O43157 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms