Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM22K7EJ46 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM22K7EJ46 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMIM22K7EJ46 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMIM22K7EJ46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMIM22K7EJ46 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SMIM22K7EJ46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMIM22K7EJ46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMIM22K7EJ46 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMIM22K7EJ46 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMIM22K7EJ46 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMIM22K7EJ46 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMIM22K7EJ46 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMIM22K7EJ46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMIM22K7EJ46 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMIM22K7EJ46 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMIM22K7EJ46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMIM22K7EJ46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMIM22K7EJ46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMIM22K7EJ46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMIM22K7EJ46 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMIM22K7EJ46 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMIM22K7EJ46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMIM22K7EJ46 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMIM22K7EJ46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMIM22K7EJ46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMIM22K7EJ46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMIM22K7EJ46 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMIM22K7EJ46 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMIM22K7EJ46 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMIM22K7EJ46 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMIM22K7EJ46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SMIM22K7EJ46 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMIM22K7EJ46 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMIM22K7EJ46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM22K7EJ46 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM22K7EJ46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMIM22K7EJ46 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMIM22K7EJ46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMIM22K7EJ46 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMIM22K7EJ46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMIM22K7EJ46 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMIM22K7EJ46 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMIM22K7EJ46 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMIM22K7EJ46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMIM22K7EJ46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMIM22K7EJ46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMIM22K7EJ46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMIM22K7EJ46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMIM22K7EJ46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMIM22K7EJ46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMIM22K7EJ46 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMIM22K7EJ46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMIM22K7EJ46 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMIM22K7EJ46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMIM22K7EJ46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMIM22K7EJ46 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms