Protein–RNA interactions for Protein: E5RJ46

C8orf87, Uncharacterized protein C8orf87, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf87E5RJ46 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf87E5RJ46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf87E5RJ46 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf87E5RJ46 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf87E5RJ46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf87E5RJ46 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf87E5RJ46 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms