Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF878C9JN71 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF878C9JN71 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF878C9JN71 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF878C9JN71 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF878C9JN71 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF878C9JN71 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF878C9JN71 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF878C9JN71 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF878C9JN71 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF878C9JN71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF878C9JN71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF878C9JN71 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF878C9JN71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF878C9JN71 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF878C9JN71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms