Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCRIP1C9JLW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms