Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM23A6NLE4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM23A6NLE4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM23A6NLE4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM23A6NLE4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM23A6NLE4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM23A6NLE4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM23A6NLE4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM23A6NLE4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM23A6NLE4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM23A6NLE4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM23A6NLE4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM23A6NLE4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM23A6NLE4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM23A6NLE4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM23A6NLE4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM23A6NLE4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM23A6NLE4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMIM23A6NLE4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM23A6NLE4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM23A6NLE4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM23A6NLE4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM23A6NLE4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM23A6NLE4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM23A6NLE4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM23A6NLE4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM23A6NLE4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMIM23A6NLE4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM23A6NLE4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM23A6NLE4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM23A6NLE4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM23A6NLE4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM23A6NLE4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM23A6NLE4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM23A6NLE4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM23A6NLE4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms