Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNF233A6NK53 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF233A6NK53 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF233A6NK53 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF233A6NK53 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF233A6NK53 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF233A6NK53 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNF233A6NK53 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF233A6NK53 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF233A6NK53 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF233A6NK53 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF233A6NK53 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF233A6NK53 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF233A6NK53 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF233A6NK53 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF233A6NK53 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF233A6NK53 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF233A6NK53 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF233A6NK53 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF233A6NK53 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZNF233A6NK53 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF233A6NK53 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF233A6NK53 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF233A6NK53 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF233A6NK53 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF233A6NK53 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF233A6NK53 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF233A6NK53 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF233A6NK53 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF233A6NK53 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF233A6NK53 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms