Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ64

Putative NPIP-like protein LOC729978, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJ64 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NJ64 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NJ64 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NJ64 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NJ64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NJ64 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NJ64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NJ64 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NJ64 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NJ64 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NJ64 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NJ64 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NJ64 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NJ64 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NJ64 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NJ64 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NJ64 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NJ64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NJ64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NJ64 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NJ64 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NJ64 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NJ64 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NJ64 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NJ64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NJ64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NJ64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NJ64 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NJ64 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NJ64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NJ64 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NJ64 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NJ64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NJ64 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NJ64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NJ64 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NJ64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NJ64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NJ64 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NJ64 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NJ64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NJ64 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NJ64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NJ64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NJ64 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NJ64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NJ64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NJ64 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NJ64 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NJ64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NJ64 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NJ64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NJ64 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NJ64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NJ64 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NJ64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NJ64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NJ64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NJ64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NJ64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NJ64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJ64 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJ64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJ64 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJ64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJ64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJ64 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A6NJ64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJ64 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJ64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJ64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJ64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJ64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJ64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJ64 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJ64 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJ64 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJ64 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NJ64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A6NJ64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A6NJ64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NJ64 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NJ64 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NJ64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NJ64 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NJ64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NJ64 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NJ64 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NJ64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NJ64 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NJ64 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NJ64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NJ64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NJ64 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NJ64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NJ64 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NJ64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NJ64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NJ64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NJ64 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms