Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL33A6NCF5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL33A6NCF5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL33A6NCF5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL33A6NCF5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KLHL33A6NCF5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL33A6NCF5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL33A6NCF5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL33A6NCF5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL33A6NCF5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHL33A6NCF5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHL33A6NCF5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHL33A6NCF5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHL33A6NCF5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL33A6NCF5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL33A6NCF5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL33A6NCF5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL33A6NCF5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL33A6NCF5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL33A6NCF5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL33A6NCF5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL33A6NCF5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL33A6NCF5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL33A6NCF5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL33A6NCF5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL33A6NCF5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL33A6NCF5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL33A6NCF5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL33A6NCF5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL33A6NCF5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHL33A6NCF5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL33A6NCF5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms