Protein–RNA interactions for Protein: A4D1Z8

GRIFIN, Grifin, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIFINA4D1Z8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIFINA4D1Z8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIFINA4D1Z8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIFINA4D1Z8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIFINA4D1Z8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIFINA4D1Z8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIFINA4D1Z8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIFINA4D1Z8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIFINA4D1Z8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIFINA4D1Z8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIFINA4D1Z8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms