Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PQLC2LA1A4F0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PQLC2LA1A4F0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PQLC2LA1A4F0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PQLC2LA1A4F0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PQLC2LA1A4F0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PQLC2LA1A4F0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PQLC2LA1A4F0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC2LA1A4F0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PQLC2LA1A4F0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PQLC2LA1A4F0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PQLC2LA1A4F0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PQLC2LA1A4F0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PQLC2LA1A4F0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PQLC2LA1A4F0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PQLC2LA1A4F0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms