Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms