RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347950.9

MFSD7-202, Transcript of Major facilitator superfamily domain-containing protein 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MFSD7, Length 1,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD7-202ENST00000347950 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.13■■■■■ 6.42
MFSD7-202ENST00000347950 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.84■■■■■ 5.41
MFSD7-202ENST00000347950 ABCC9O60706 1549 aa47.53■■■■■ 5.2
MFSD7-202ENST00000347950 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
MFSD7-202ENST00000347950 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.95■■■■■ 4.95
MFSD7-202ENST00000347950 NACADO15069 1562 aa45.87■■■■■ 4.93
MFSD7-202ENST00000347950 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.84■■■■■ 4.93
MFSD7-202ENST00000347950 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.71■■■■■ 4.91
MFSD7-202ENST00000347950 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.62■■■■■ 4.89
MFSD7-202ENST00000347950 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.76■■■■■ 4.76
MFSD7-202ENST00000347950 SCRIBQ14160 1630 aa44.61■■■■■ 4.73
MFSD7-202ENST00000347950 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.48■■■■■ 4.71
MFSD7-202ENST00000347950 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.46■■■■■ 4.71
MFSD7-202ENST00000347950 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.01■■■■■ 4.64
MFSD7-202ENST00000347950 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.36■■■■■ 4.53
MFSD7-202ENST00000347950 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
MFSD7-202ENST00000347950 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.99■■■■■ 4.47
MFSD7-202ENST00000347950 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.93■■■■■ 4.46
MFSD7-202ENST00000347950 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
MFSD7-202ENST00000347950 SMARCA4P51532 1647 aa42.7■■■■■ 4.43
MFSD7-202ENST00000347950 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.5■■■■■ 4.39
MFSD7-202ENST00000347950 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.41■■■■■ 4.38
MFSD7-202ENST00000347950 SMARCA2P51531 1590 aa42.37■■■■■ 4.37
MFSD7-202ENST00000347950 NCAPD3P42695 1498 aa42.34■■■■■ 4.37
MFSD7-202ENST00000347950 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.29■■■■■ 4.36
MFSD7-202ENST00000347950 HMGXB3Q12766 1538 aa42.15■■■■■ 4.34
MFSD7-202ENST00000347950 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
MFSD7-202ENST00000347950 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
MFSD7-202ENST00000347950 WIZO95785 1651 aa42.04■■■■■ 4.32
MFSD7-202ENST00000347950 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
MFSD7-202ENST00000347950 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
MFSD7-202ENST00000347950 NESP48681 1621 aa41.23■■■■■ 4.19
MFSD7-202ENST00000347950 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.15■■■■■ 4.18
MFSD7-202ENST00000347950 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.15■■■■■ 4.18
MFSD7-202ENST00000347950 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.13■■■■■ 4.17
MFSD7-202ENST00000347950 CFTRP13569 1480 aa40.96■■■■■ 4.15
MFSD7-202ENST00000347950 ERCC6Q03468 1493 aa40.95■■■■■ 4.15
MFSD7-202ENST00000347950 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.88■■■■■ 4.13
MFSD7-202ENST00000347950 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.71■■■■■ 4.11
MFSD7-202ENST00000347950 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.66■■■■■ 4.1
MFSD7-202ENST00000347950 PRDM2Q13029 1718 aa40.59■■■■■ 4.09
MFSD7-202ENST00000347950 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.57■■■■■ 4.08
MFSD7-202ENST00000347950 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
MFSD7-202ENST00000347950 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.45■■■■■ 4.07
MFSD7-202ENST00000347950 CUX2O14529 1486 aa40.39■■■■■ 4.06
MFSD7-202ENST00000347950 WDR62O43379 1518 aa40.3■■■■■ 4.04
MFSD7-202ENST00000347950 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
MFSD7-202ENST00000347950 TOPBP1Q92547 1522 aa40.04■■■■■ 4
MFSD7-202ENST00000347950 ABCC8Q09428 1581 aa40.03■■■■■ 4
MFSD7-202ENST00000347950 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.01■■■■■ 4
MFSD7-202ENST00000347950 CUX1P39880 1505 aa39.86■■■■□ 3.97
MFSD7-202ENST00000347950 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.73■■■■□ 3.95
MFSD7-202ENST00000347950 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
MFSD7-202ENST00000347950 IFT140Q96RY7 1462 aa39.7■■■■□ 3.95
MFSD7-202ENST00000347950 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.67■■■■□ 3.94
MFSD7-202ENST00000347950 SYNJ1O43426 1573 aa39.6■■■■□ 3.93
MFSD7-202ENST00000347950 TOP2BQ02880 1626 aa39.58■■■■□ 3.93
MFSD7-202ENST00000347950 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
MFSD7-202ENST00000347950 SOGA1O94964 1423 aa39.56■■■■□ 3.92
MFSD7-202ENST00000347950 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.56■■■■□ 3.92
MFSD7-202ENST00000347950 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.55■■■■□ 3.92
MFSD7-202ENST00000347950 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.91
MFSD7-202ENST00000347950 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
MFSD7-202ENST00000347950 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.33■■■■□ 3.89
MFSD7-202ENST00000347950 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.88
MFSD7-202ENST00000347950 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.3■■■■□ 3.88
MFSD7-202ENST00000347950 WDR97A6NE52 1622 aa39.3■■■■□ 3.88
MFSD7-202ENST00000347950 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.12■■■■□ 3.85
MFSD7-202ENST00000347950 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.1■■■■□ 3.85
MFSD7-202ENST00000347950 GRIN2BQ13224 1484 aa39.06■■■■□ 3.84
MFSD7-202ENST00000347950 TRIM41Q8WV44 630 aa39■■■■□ 3.83
MFSD7-202ENST00000347950 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.97■■■■□ 3.83
MFSD7-202ENST00000347950 PBRM1Q86U86 1689 aa38.96■■■■□ 3.83
MFSD7-202ENST00000347950 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
MFSD7-202ENST00000347950 KIF27Q86VH2 1401 aa38.87■■■■□ 3.81
MFSD7-202ENST00000347950 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.83■■■■□ 3.81
MFSD7-202ENST00000347950 FBLN2P98095 1184 aa38.8■■■■□ 3.8
MFSD7-202ENST00000347950 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.79■■■■□ 3.8
MFSD7-202ENST00000347950 OSCARQ8IYS5 282 aa38.78■■■■□ 3.8
MFSD7-202ENST00000347950 SYNJ2O15056 1496 aa38.77■■■■□ 3.8
MFSD7-202ENST00000347950 CHD1O14646 1710 aa38.76■■■■□ 3.8
MFSD7-202ENST00000347950 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.74■■■■□ 3.79
MFSD7-202ENST00000347950 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
MFSD7-202ENST00000347950 ADAMTS12P58397 1594 aa38.71■■■■□ 3.79
MFSD7-202ENST00000347950 IGF1RP08069 1367 aa38.67■■■■□ 3.78
MFSD7-202ENST00000347950 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.67■■■■□ 3.78
MFSD7-202ENST00000347950 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.61■■■■□ 3.77
MFSD7-202ENST00000347950 GRIN2AQ12879 1464 aa38.56■■■■□ 3.76
MFSD7-202ENST00000347950 CUL7Q14999 1698 aa38.51■■■■□ 3.76
MFSD7-202ENST00000347950 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.45■■■■□ 3.75
MFSD7-202ENST00000347950 NUP160Q12769 1436 aa38.39■■■■□ 3.74
MFSD7-202ENST00000347950 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.38■■■■□ 3.73
MFSD7-202ENST00000347950 CEP170Q5SW79 1584 aa38.35■■■■□ 3.73
MFSD7-202ENST00000347950 EEA1Q15075 1411 aa38.32■■■■□ 3.72
MFSD7-202ENST00000347950 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.25■■■■□ 3.71
MFSD7-202ENST00000347950 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.23■■■■□ 3.71
MFSD7-202ENST00000347950 PRXQ9BXM0 1461 aa38.21■■■■□ 3.71
MFSD7-202ENST00000347950 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
MFSD7-202ENST00000347950 ARHGEF11O15085 1522 aa38.16■■■■□ 3.7
MFSD7-202ENST00000347950 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.1■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms