RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308388.6

GMPPB-202, Transcript of GDP-mannose pyrophosphorylase B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GMPPB, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMPPB-202ENST00000308388 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.98■■■■■ 6.39
GMPPB-202ENST00000308388 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.76■■■■■ 5.4
GMPPB-202ENST00000308388 ABCC9O60706 1549 aa47.81■■■■■ 5.24
GMPPB-202ENST00000308388 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.01■■■■■ 4.96
GMPPB-202ENST00000308388 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.92■■■■■ 4.94
GMPPB-202ENST00000308388 NACADO15069 1562 aa45.88■■■■■ 4.94
GMPPB-202ENST00000308388 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
GMPPB-202ENST00000308388 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.62■■■■■ 4.89
GMPPB-202ENST00000308388 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.45■■■■■ 4.87
GMPPB-202ENST00000308388 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.89■■■■■ 4.78
GMPPB-202ENST00000308388 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.75■■■■■ 4.75
GMPPB-202ENST00000308388 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.6■■■■■ 4.73
GMPPB-202ENST00000308388 SCRIBQ14160 1630 aa44.58■■■■■ 4.73
GMPPB-202ENST00000308388 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.01■■■■■ 4.64
GMPPB-202ENST00000308388 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.97■■■■■ 4.63
GMPPB-202ENST00000308388 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
GMPPB-202ENST00000308388 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.21■■■■■ 4.51
GMPPB-202ENST00000308388 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.93■■■■■ 4.46
GMPPB-202ENST00000308388 SMARCA4P51532 1647 aa42.63■■■■■ 4.41
GMPPB-202ENST00000308388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
GMPPB-202ENST00000308388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.43■■■■■ 4.38
GMPPB-202ENST00000308388 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.41■■■■■ 4.38
GMPPB-202ENST00000308388 NCAPD3P42695 1498 aa42.39■■■■■ 4.38
GMPPB-202ENST00000308388 SMARCA2P51531 1590 aa42.31■■■■■ 4.36
GMPPB-202ENST00000308388 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.2■■■■■ 4.35
GMPPB-202ENST00000308388 HMGXB3Q12766 1538 aa42.13■■■■■ 4.33
GMPPB-202ENST00000308388 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
GMPPB-202ENST00000308388 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.31
GMPPB-202ENST00000308388 WIZO95785 1651 aa41.93■■■■■ 4.3
GMPPB-202ENST00000308388 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
GMPPB-202ENST00000308388 NESP48681 1621 aa41.41■■■■■ 4.22
GMPPB-202ENST00000308388 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.21■■■■■ 4.19
GMPPB-202ENST00000308388 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.17■■■■■ 4.18
GMPPB-202ENST00000308388 ERCC6Q03468 1493 aa41.15■■■■■ 4.18
GMPPB-202ENST00000308388 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.03■■■■■ 4.16
GMPPB-202ENST00000308388 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.96■■■■■ 4.15
GMPPB-202ENST00000308388 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
GMPPB-202ENST00000308388 CFTRP13569 1480 aa40.92■■■■■ 4.14
GMPPB-202ENST00000308388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.84■■■■■ 4.13
GMPPB-202ENST00000308388 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
GMPPB-202ENST00000308388 CUX2O14529 1486 aa40.68■■■■■ 4.1
GMPPB-202ENST00000308388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.68■■■■■ 4.1
GMPPB-202ENST00000308388 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.59■■■■■ 4.09
GMPPB-202ENST00000308388 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.54■■■■■ 4.08
GMPPB-202ENST00000308388 PRDM2Q13029 1718 aa40.49■■■■■ 4.07
GMPPB-202ENST00000308388 WDR62O43379 1518 aa40.39■■■■■ 4.06
GMPPB-202ENST00000308388 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
GMPPB-202ENST00000308388 TOPBP1Q92547 1522 aa40.03■■■■■ 4
GMPPB-202ENST00000308388 ABCC8Q09428 1581 aa39.98■■■■□ 3.99
GMPPB-202ENST00000308388 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.95■■■■□ 3.99
GMPPB-202ENST00000308388 CUX1P39880 1505 aa39.76■■■■□ 3.95
GMPPB-202ENST00000308388 IFT140Q96RY7 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
GMPPB-202ENST00000308388 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
GMPPB-202ENST00000308388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
GMPPB-202ENST00000308388 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.61■■■■□ 3.93
GMPPB-202ENST00000308388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
GMPPB-202ENST00000308388 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.57■■■■□ 3.93
GMPPB-202ENST00000308388 SOGA1O94964 1423 aa39.56■■■■□ 3.92
GMPPB-202ENST00000308388 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.51■■■■□ 3.92
GMPPB-202ENST00000308388 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.5■■■■□ 3.91
GMPPB-202ENST00000308388 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.42■■■■□ 3.96e-9■■■■■ 45.1
GMPPB-202ENST00000308388 SYNJ1O43426 1573 aa39.41■■■■□ 3.9
GMPPB-202ENST00000308388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
GMPPB-202ENST00000308388 TOP2BQ02880 1626 aa39.39■■■■□ 3.9
GMPPB-202ENST00000308388 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.37■■■■□ 3.89
GMPPB-202ENST00000308388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
GMPPB-202ENST00000308388 WDR97A6NE52 1622 aa39.22■■■■□ 3.87
GMPPB-202ENST00000308388 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.21■■■■□ 3.87
GMPPB-202ENST00000308388 OSCARQ8IYS5 282 aa39.08■■■■□ 3.85
GMPPB-202ENST00000308388 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.07■■■■□ 3.85
GMPPB-202ENST00000308388 GRIN2BQ13224 1484 aa39.05■■■■□ 3.84
GMPPB-202ENST00000308388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.03■■■■□ 3.84
GMPPB-202ENST00000308388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39■■■■□ 3.83
GMPPB-202ENST00000308388 FBLN2P98095 1184 aa38.94■■■■□ 3.82
GMPPB-202ENST00000308388 PBRM1Q86U86 1689 aa38.93■■■■□ 3.82
GMPPB-202ENST00000308388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
GMPPB-202ENST00000308388 CHD1O14646 1710 aa38.89■■■■□ 3.82
GMPPB-202ENST00000308388 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.81
GMPPB-202ENST00000308388 SYNJ2O15056 1496 aa38.79■■■■□ 3.8
GMPPB-202ENST00000308388 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.72■■■■□ 3.79
GMPPB-202ENST00000308388 KIF27Q86VH2 1401 aa38.66■■■■□ 3.78
GMPPB-202ENST00000308388 ADAMTS12P58397 1594 aa38.64■■■■□ 3.78
GMPPB-202ENST00000308388 TRIM41Q8WV44 630 aa38.63■■■■□ 3.77
GMPPB-202ENST00000308388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.62■■■■□ 3.77
GMPPB-202ENST00000308388 IGF1RP08069 1367 aa38.58■■■■□ 3.77
GMPPB-202ENST00000308388 GRIN2AQ12879 1464 aa38.56■■■■□ 3.76
GMPPB-202ENST00000308388 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.5■■■■□ 3.75
GMPPB-202ENST00000308388 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.42■■■■□ 3.74
GMPPB-202ENST00000308388 ARHGEF11O15085 1522 aa38.42■■■■□ 3.74
GMPPB-202ENST00000308388 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
GMPPB-202ENST00000308388 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
GMPPB-202ENST00000308388 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
GMPPB-202ENST00000308388 NUP160Q12769 1436 aa38.4■■■■□ 3.74
GMPPB-202ENST00000308388 CEP170Q5SW79 1584 aa38.38■■■■□ 3.73
GMPPB-202ENST00000308388 CUL7Q14999 1698 aa38.34■■■■□ 3.73
GMPPB-202ENST00000308388 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.31■■■■□ 3.72
GMPPB-202ENST00000308388 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.24■■■■□ 3.71
GMPPB-202ENST00000308388 ARAP1Q96P48 1450 aa38.13■■■■□ 3.69
GMPPB-202ENST00000308388 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.13■■■■□ 3.69
GMPPB-202ENST00000308388 SHROOM2Q13796 1616 aa38.07■■■■□ 3.68
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