RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369126.5

PLEKHO1-202, Transcript of pleckstrin homology domain containing O1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHO1, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHO1-202ENST00000369126 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.67■■■■■ 6.5
PLEKHO1-202ENST00000369126 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.91■■■■■ 5.42
PLEKHO1-202ENST00000369126 ABCC9O60706 1549 aa47.27■■■■■ 5.16
PLEKHO1-202ENST00000369126 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
PLEKHO1-202ENST00000369126 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.42■■■■■ 5.02
PLEKHO1-202ENST00000369126 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.9■■■■■ 4.94
PLEKHO1-202ENST00000369126 NACADO15069 1562 aa45.76■■■■■ 4.92
PLEKHO1-202ENST00000369126 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.67■■■■■ 4.9
PLEKHO1-202ENST00000369126 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.62■■■■■ 4.89
PLEKHO1-202ENST00000369126 SCRIBQ14160 1630 aa45.03■■■■■ 4.8
PLEKHO1-202ENST00000369126 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.97■■■■■ 4.79
PLEKHO1-202ENST00000369126 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.8■■■■■ 4.76
PLEKHO1-202ENST00000369126 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.43■■■■■ 4.7
PLEKHO1-202ENST00000369126 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.37■■■■■ 4.69
PLEKHO1-202ENST00000369126 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.44■■■■■ 4.55
PLEKHO1-202ENST00000369126 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
PLEKHO1-202ENST00000369126 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.06■■■■■ 4.48
PLEKHO1-202ENST00000369126 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
PLEKHO1-202ENST00000369126 SMARCA4P51532 1647 aa43.01■■■■■ 4.48
PLEKHO1-202ENST00000369126 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
PLEKHO1-202ENST00000369126 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
PLEKHO1-202ENST00000369126 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.7■■■■■ 4.43
PLEKHO1-202ENST00000369126 WIZO95785 1651 aa42.67■■■■■ 4.42
PLEKHO1-202ENST00000369126 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.61■■■■■ 4.41
PLEKHO1-202ENST00000369126 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.53■■■■■ 4.4
PLEKHO1-202ENST00000369126 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.44■■■■■ 4.38
PLEKHO1-202ENST00000369126 SMARCA2P51531 1590 aa42.41■■■■■ 4.38
PLEKHO1-202ENST00000369126 NCAPD3P42695 1498 aa42.25■■■■■ 4.35
PLEKHO1-202ENST00000369126 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
PLEKHO1-202ENST00000369126 HMGXB3Q12766 1538 aa42.12■■■■■ 4.33
PLEKHO1-202ENST00000369126 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PLEKHO1-202ENST00000369126 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.71■■■■■ 4.27
PLEKHO1-202ENST00000369126 NESP48681 1621 aa41.24■■■■■ 4.19
PLEKHO1-202ENST00000369126 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.14■■■■■ 4.18
PLEKHO1-202ENST00000369126 CFTRP13569 1480 aa41.09■■■■■ 4.17
PLEKHO1-202ENST00000369126 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.97■■■■■ 4.15
PLEKHO1-202ENST00000369126 PRDM2Q13029 1718 aa40.81■■■■■ 4.12
PLEKHO1-202ENST00000369126 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.73■■■■■ 4.11
PLEKHO1-202ENST00000369126 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.69■■■■■ 4.1
PLEKHO1-202ENST00000369126 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
PLEKHO1-202ENST00000369126 ABCC8Q09428 1581 aa40.62■■■■■ 4.09
PLEKHO1-202ENST00000369126 ERCC6Q03468 1493 aa40.55■■■■■ 4.08
PLEKHO1-202ENST00000369126 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.54■■■■■ 4.08
PLEKHO1-202ENST00000369126 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.35■■■■■ 4.05
PLEKHO1-202ENST00000369126 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
PLEKHO1-202ENST00000369126 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
PLEKHO1-202ENST00000369126 CUX1P39880 1505 aa40.3■■■■■ 4.04
PLEKHO1-202ENST00000369126 SYNJ1O43426 1573 aa40.3■■■■■ 4.04
PLEKHO1-202ENST00000369126 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.26■■■■■ 4.03
PLEKHO1-202ENST00000369126 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
PLEKHO1-202ENST00000369126 TOPBP1Q92547 1522 aa40.19■■■■■ 4.02
PLEKHO1-202ENST00000369126 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.16■■■■■ 4.02
PLEKHO1-202ENST00000369126 TRIM41Q8WV44 630 aa40.15■■■■■ 4.02
PLEKHO1-202ENST00000369126 TOP2BQ02880 1626 aa40.11■■■■■ 4.01
PLEKHO1-202ENST00000369126 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.09■■■■■ 4.01
PLEKHO1-202ENST00000369126 WDR62O43379 1518 aa40.08■■■■■ 4.01
PLEKHO1-202ENST00000369126 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40■■■■□ 3.99
PLEKHO1-202ENST00000369126 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
PLEKHO1-202ENST00000369126 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.86■■■■□ 3.97
PLEKHO1-202ENST00000369126 CUX2O14529 1486 aa39.82■■■■□ 3.97
PLEKHO1-202ENST00000369126 SOGA1O94964 1423 aa39.76■■■■□ 3.96
PLEKHO1-202ENST00000369126 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
PLEKHO1-202ENST00000369126 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.59■■■■□ 3.93
PLEKHO1-202ENST00000369126 IFT140Q96RY7 1462 aa39.59■■■■□ 3.93
PLEKHO1-202ENST00000369126 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
PLEKHO1-202ENST00000369126 WDR97A6NE52 1622 aa39.55■■■■□ 3.92
PLEKHO1-202ENST00000369126 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.55■■■■□ 3.92
PLEKHO1-202ENST00000369126 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
PLEKHO1-202ENST00000369126 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
PLEKHO1-202ENST00000369126 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.91
PLEKHO1-202ENST00000369126 KIF27Q86VH2 1401 aa39.37■■■■□ 3.89
PLEKHO1-202ENST00000369126 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.35■■■■□ 3.89
PLEKHO1-202ENST00000369126 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
PLEKHO1-202ENST00000369126 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.31■■■■□ 3.88
PLEKHO1-202ENST00000369126 PBRM1Q86U86 1689 aa39.18■■■■□ 3.86
PLEKHO1-202ENST00000369126 IGF1RP08069 1367 aa39.17■■■■□ 3.86
PLEKHO1-202ENST00000369126 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.14■■■■□ 3.86
PLEKHO1-202ENST00000369126 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.14■■■■□ 3.86
PLEKHO1-202ENST00000369126 EEA1Q15075 1411 aa39.13■■■■□ 3.85
PLEKHO1-202ENST00000369126 GRIN2BQ13224 1484 aa39.11■■■■□ 3.85
PLEKHO1-202ENST00000369126 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.05■■■■□ 3.84
PLEKHO1-202ENST00000369126 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.04■■■■□ 3.84
PLEKHO1-202ENST00000369126 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.94■■■■□ 3.82
PLEKHO1-202ENST00000369126 ADAMTS12P58397 1594 aa38.9■■■■□ 3.82
PLEKHO1-202ENST00000369126 PRXQ9BXM0 1461 aa38.89■■■■□ 3.82
PLEKHO1-202ENST00000369126 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.89■■■■□ 3.82
PLEKHO1-202ENST00000369126 CUL7Q14999 1698 aa38.88■■■■□ 3.82
PLEKHO1-202ENST00000369126 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
PLEKHO1-202ENST00000369126 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.85■■■■□ 3.81
PLEKHO1-202ENST00000369126 FBLN2P98095 1184 aa38.84■■■■□ 3.81
PLEKHO1-202ENST00000369126 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.82■■■■□ 3.81
PLEKHO1-202ENST00000369126 KIF21BO75037 1637 aa38.78■■■■□ 3.8
PLEKHO1-202ENST00000369126 SYNJ2O15056 1496 aa38.75■■■■□ 3.79
PLEKHO1-202ENST00000369126 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
PLEKHO1-202ENST00000369126 CHD1O14646 1710 aa38.7■■■■□ 3.79
PLEKHO1-202ENST00000369126 GOLGA3Q08378 1498 aa38.66■■■■□ 3.78
PLEKHO1-202ENST00000369126 GRIN2AQ12879 1464 aa38.66■■■■□ 3.78
PLEKHO1-202ENST00000369126 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
PLEKHO1-202ENST00000369126 CEP170Q5SW79 1584 aa38.5■■■■□ 3.75
PLEKHO1-202ENST00000369126 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms