RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375227.8

LLGL2-202, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-202ENST00000375227 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.88■■■■■ 6.38
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LLGL2-202ENST00000375227 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.25■■■■■ 4.35
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LLGL2-202ENST00000375227 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.52■■■■■ 4.24
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LLGL2-202ENST00000375227 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
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LLGL2-202ENST00000375227 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.88■■■■■ 4.13
LLGL2-202ENST00000375227 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.85■■■■■ 4.13
LLGL2-202ENST00000375227 WDR62O43379 1518 aa40.79■■■■■ 4.12
LLGL2-202ENST00000375227 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.68■■■■■ 4.1
LLGL2-202ENST00000375227 PRDM2Q13029 1718 aa40.64■■■■■ 4.1
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LLGL2-202ENST00000375227 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.24■■■■□ 3.87
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LLGL2-202ENST00000375227 GRIN2BQ13224 1484 aa39.2■■■■□ 3.87
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LLGL2-202ENST00000375227 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.11■■■■□ 3.85
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LLGL2-202ENST00000375227 SHROOM2Q13796 1616 aa38.33■■■■□ 3.73
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LLGL2-202ENST00000375227 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
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