RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.91■■■■■ 6.54
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.36■■■■■ 5.49
PDSS1-201ENST00000376215 ABCC9O60706 1549 aa47.55■■■■■ 5.2
PDSS1-201ENST00000376215 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
PDSS1-201ENST00000376215 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.35■■■■■ 5.01
PDSS1-201ENST00000376215 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.27■■■■■ 5
PDSS1-201ENST00000376215 NACADO15069 1562 aa46.18■■■■■ 4.98
PDSS1-201ENST00000376215 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.15■■■■■ 4.98
PDSS1-201ENST00000376215 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.04■■■■■ 4.96
PDSS1-201ENST00000376215 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.17■■■■■ 4.82
PDSS1-201ENST00000376215 SCRIBQ14160 1630 aa45.15■■■■■ 4.82
PDSS1-201ENST00000376215 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.71■■■■■ 4.75
PDSS1-201ENST00000376215 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.69■■■■■ 4.74
PDSS1-201ENST00000376215 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.55■■■■■ 4.72
PDSS1-201ENST00000376215 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.51■■■■■ 4.56
PDSS1-201ENST00000376215 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
PDSS1-201ENST00000376215 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
PDSS1-201ENST00000376215 SMARCA4P51532 1647 aa43.24■■■■■ 4.51
PDSS1-201ENST00000376215 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.15■■■■■ 4.5
PDSS1-201ENST00000376215 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.07■■■■■ 4.49
PDSS1-201ENST00000376215 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.95■■■■■ 4.47
PDSS1-201ENST00000376215 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
PDSS1-201ENST00000376215 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.79■■■■■ 4.44
PDSS1-201ENST00000376215 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.78■■■■■ 4.44
PDSS1-201ENST00000376215 WIZO95785 1651 aa42.75■■■■■ 4.43
PDSS1-201ENST00000376215 SMARCA2P51531 1590 aa42.73■■■■■ 4.43
PDSS1-201ENST00000376215 NCAPD3P42695 1498 aa42.6■■■■■ 4.41
PDSS1-201ENST00000376215 HMGXB3Q12766 1538 aa42.48■■■■■ 4.39
PDSS1-201ENST00000376215 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
PDSS1-201ENST00000376215 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
PDSS1-201ENST00000376215 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.79■■■■■ 4.28
PDSS1-201ENST00000376215 NESP48681 1621 aa41.41■■■■■ 4.22
PDSS1-201ENST00000376215 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.4■■■■■ 4.22
PDSS1-201ENST00000376215 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.36■■■■■ 4.21
PDSS1-201ENST00000376215 CFTRP13569 1480 aa41.34■■■■■ 4.21
PDSS1-201ENST00000376215 PRDM2Q13029 1718 aa41.18■■■■■ 4.18
PDSS1-201ENST00000376215 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.01■■■■■ 4.15
PDSS1-201ENST00000376215 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.98■■■■■ 4.15
PDSS1-201ENST00000376215 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.95■■■■■ 4.15
PDSS1-201ENST00000376215 ERCC6Q03468 1493 aa40.86■■■■■ 4.13
PDSS1-201ENST00000376215 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.81■■■■■ 4.12
PDSS1-201ENST00000376215 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
PDSS1-201ENST00000376215 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.58■■■■■ 4.09
PDSS1-201ENST00000376215 ABCC8Q09428 1581 aa40.56■■■■■ 4.08
PDSS1-201ENST00000376215 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
PDSS1-201ENST00000376215 WDR62O43379 1518 aa40.45■■■■■ 4.07
PDSS1-201ENST00000376215 CUX1P39880 1505 aa40.42■■■■■ 4.06
PDSS1-201ENST00000376215 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.42■■■■■ 4.06
PDSS1-201ENST00000376215 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.41■■■■■ 4.06
PDSS1-201ENST00000376215 TOPBP1Q92547 1522 aa40.4■■■■■ 4.06
PDSS1-201ENST00000376215 SYNJ1O43426 1573 aa40.34■■■■■ 4.05
PDSS1-201ENST00000376215 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.28■■■■■ 4.04
PDSS1-201ENST00000376215 TOP2BQ02880 1626 aa40.27■■■■■ 4.04
PDSS1-201ENST00000376215 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.13■■■■■ 4.01
PDSS1-201ENST00000376215 CUX2O14529 1486 aa40.12■■■■■ 4.01
PDSS1-201ENST00000376215 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
PDSS1-201ENST00000376215 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.05■■■■■ 4
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM41Q8WV44 630 aa39.98■■■■□ 3.99
PDSS1-201ENST00000376215 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.95■■■■□ 3.99
PDSS1-201ENST00000376215 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
PDSS1-201ENST00000376215 SOGA1O94964 1423 aa39.92■■■■□ 3.98
PDSS1-201ENST00000376215 IFT140Q96RY7 1462 aa39.9■■■■□ 3.98
PDSS1-201ENST00000376215 WDR97A6NE52 1622 aa39.82■■■■□ 3.97
PDSS1-201ENST00000376215 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.77■■■■□ 3.96
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
PDSS1-201ENST00000376215 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.93
PDSS1-201ENST00000376215 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
PDSS1-201ENST00000376215 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.59■■■■□ 3.93
PDSS1-201ENST00000376215 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.58■■■■□ 3.93
PDSS1-201ENST00000376215 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.49■■■■□ 3.91
PDSS1-201ENST00000376215 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.47■■■■□ 3.91
PDSS1-201ENST00000376215 KIF27Q86VH2 1401 aa39.47■■■■□ 3.91
PDSS1-201ENST00000376215 PBRM1Q86U86 1689 aa39.44■■■■□ 3.9
PDSS1-201ENST00000376215 GRIN2BQ13224 1484 aa39.36■■■■□ 3.89
PDSS1-201ENST00000376215 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.3■■■■□ 3.88
PDSS1-201ENST00000376215 IGF1RP08069 1367 aa39.25■■■■□ 3.87
PDSS1-201ENST00000376215 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.24■■■■□ 3.87
PDSS1-201ENST00000376215 EEA1Q15075 1411 aa39.22■■■■□ 3.87
PDSS1-201ENST00000376215 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
PDSS1-201ENST00000376215 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
PDSS1-201ENST00000376215 ADAMTS12P58397 1594 aa39.14■■■■□ 3.86
PDSS1-201ENST00000376215 CUL7Q14999 1698 aa39.11■■■■□ 3.85
PDSS1-201ENST00000376215 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.07■■■■□ 3.85
PDSS1-201ENST00000376215 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.04■■■■□ 3.84
PDSS1-201ENST00000376215 SYNJ2O15056 1496 aa39.02■■■■□ 3.84
PDSS1-201ENST00000376215 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.01■■■■□ 3.84
PDSS1-201ENST00000376215 CHD1O14646 1710 aa39■■■■□ 3.83
PDSS1-201ENST00000376215 PRXQ9BXM0 1461 aa38.96■■■■□ 3.83
PDSS1-201ENST00000376215 FBLN2P98095 1184 aa38.9■■■■□ 3.82
PDSS1-201ENST00000376215 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
PDSS1-201ENST00000376215 GRIN2AQ12879 1464 aa38.88■■■■□ 3.82
PDSS1-201ENST00000376215 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.88■■■■□ 3.81
PDSS1-201ENST00000376215 KIF21BO75037 1637 aa38.84■■■■□ 3.81
PDSS1-201ENST00000376215 CEP170Q5SW79 1584 aa38.7■■■■□ 3.79
PDSS1-201ENST00000376215 NUP160Q12769 1436 aa38.67■■■■□ 3.78
PDSS1-201ENST00000376215 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.63■■■■□ 3.78
PDSS1-201ENST00000376215 GOLGA3Q08378 1498 aa38.63■■■■□ 3.77
PDSS1-201ENST00000376215 OSCARQ8IYS5 282 aa38.6■■■■□ 3.77
PDSS1-201ENST00000376215 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.55■■■■□ 3.76
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