RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438755.1

GATA3-AS1-204, GATA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GATA3-AS1, Length 675 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA3-AS1-204ENST00000438755 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.78■■■■■ 6.2
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.5■■■■■ 5.03
GATA3-AS1-204ENST00000438755 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.43■■■■■ 5.02
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.08■■■■■ 4.81
GATA3-AS1-204ENST00000438755 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.57■■■■■ 4.73
GATA3-AS1-204ENST00000438755 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.45■■■■■ 4.71
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.28■■■■■ 4.68
GATA3-AS1-204ENST00000438755 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.26■■■■■ 4.68
GATA3-AS1-204ENST00000438755 SCRIBQ14160 1630 aa44.11■■■■■ 4.65
GATA3-AS1-204ENST00000438755 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
GATA3-AS1-204ENST00000438755 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.17■■■■■ 4.5
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 ERCC6Q03468 1493 aa42.43■■■■■ 4.38
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 SMARCA2P51531 1590 aa42.16■■■■■ 4.34
GATA3-AS1-204ENST00000438755 HMGXB3Q12766 1538 aa42.14■■■■■ 4.34
GATA3-AS1-204ENST00000438755 SMARCA4P51532 1647 aa42.06■■■■■ 4.32
GATA3-AS1-204ENST00000438755 NESP48681 1621 aa41.91■■■■■ 4.3
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
GATA3-AS1-204ENST00000438755 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.65■■■■■ 4.26
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.39■■■■■ 4.22
GATA3-AS1-204ENST00000438755 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.37■■■■■ 4.21
GATA3-AS1-204ENST00000438755 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.16■■■■■ 4.18
GATA3-AS1-204ENST00000438755 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.08■■■■■ 4.17
GATA3-AS1-204ENST00000438755 WDR62O43379 1518 aa40.99■■■■■ 4.15
GATA3-AS1-204ENST00000438755 TRIM41Q8WV44 630 aa40.98■■■■■ 4.15
GATA3-AS1-204ENST00000438755 WIZO95785 1651 aa40.85■■■■■ 4.13
GATA3-AS1-204ENST00000438755 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.8■■■■■ 4.12
GATA3-AS1-204ENST00000438755 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.69■■■■■ 4.1
GATA3-AS1-204ENST00000438755 CFTRP13569 1480 aa40.58■■■■■ 4.09
GATA3-AS1-204ENST00000438755 OSCARQ8IYS5 282 aa40.53■■■■■ 4.08
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
GATA3-AS1-204ENST00000438755 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
GATA3-AS1-204ENST00000438755 PRDM2Q13029 1718 aa40.13■■■■■ 4.02
GATA3-AS1-204ENST00000438755 IFT140Q96RY7 1462 aa40.02■■■■■ 4
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 ARHGEF11O15085 1522 aa39.83■■■■□ 3.97
GATA3-AS1-204ENST00000438755 ABCC8Q09428 1581 aa39.82■■■■□ 3.97
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.57■■■■□ 3.93
GATA3-AS1-204ENST00000438755 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
GATA3-AS1-204ENST00000438755 CHD1O14646 1710 aa39.52■■■■□ 3.92
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
GATA3-AS1-204ENST00000438755 FBLN2P98095 1184 aa39.39■■■■□ 3.9
GATA3-AS1-204ENST00000438755 ARAP1Q96P48 1450 aa39.38■■■■□ 3.9
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 WDR97A6NE52 1622 aa39.19■■■■□ 3.86
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
GATA3-AS1-204ENST00000438755 SYNJ1O43426 1573 aa39.05■■■■□ 3.84
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 PBRM1Q86U86 1689 aa38.74■■■■□ 3.79
GATA3-AS1-204ENST00000438755 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.73■■■■□ 3.79
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GATA3-AS1-204ENST00000438755 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.73
GATA3-AS1-204ENST00000438755 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.36■■■■□ 3.73
GATA3-AS1-204ENST00000438755 NUP160Q12769 1436 aa38.35■■■■□ 3.73
GATA3-AS1-204ENST00000438755 ADAMTS12P58397 1594 aa38.34■■■■□ 3.73
GATA3-AS1-204ENST00000438755 CEP170Q5SW79 1584 aa38.32■■■■□ 3.73
GATA3-AS1-204ENST00000438755 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.25■■■■□ 3.71
GATA3-AS1-204ENST00000438755 SHROOM2Q13796 1616 aa38.24■■■■□ 3.71
GATA3-AS1-204ENST00000438755 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.19■■■■□ 3.7
GATA3-AS1-204ENST00000438755 TOP2BQ02880 1626 aa38.18■■■■□ 3.7
GATA3-AS1-204ENST00000438755 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.15■■■■□ 3.7
GATA3-AS1-204ENST00000438755 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
GATA3-AS1-204ENST00000438755 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.01■■■■□ 3.68
GATA3-AS1-204ENST00000438755 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
GATA3-AS1-204ENST00000438755 JPH4Q96JJ6 628 aa37.96■■■■□ 3.67
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