RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.45■■■■■ 6.31
SYT6-210ENST00000641643 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.44■■■■■ 5.35
SYT6-210ENST00000641643 ABCC9O60706 1549 aa47.73■■■■■ 5.23
SYT6-210ENST00000641643 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.79■■■■■ 4.92
SYT6-210ENST00000641643 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.77■■■■■ 4.92
SYT6-210ENST00000641643 NACADO15069 1562 aa45.67■■■■■ 4.9
SYT6-210ENST00000641643 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
SYT6-210ENST00000641643 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.29■■■■■ 4.84
SYT6-210ENST00000641643 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.02■■■■■ 4.8
SYT6-210ENST00000641643 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.73
SYT6-210ENST00000641643 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.62■■■■■ 4.73
SYT6-210ENST00000641643 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.32■■■■■ 4.69
SYT6-210ENST00000641643 SCRIBQ14160 1630 aa44.25■■■■■ 4.67
SYT6-210ENST00000641643 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44■■■■■ 4.63
SYT6-210ENST00000641643 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.89■■■■■ 4.62
SYT6-210ENST00000641643 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
SYT6-210ENST00000641643 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.12■■■■■ 4.49
SYT6-210ENST00000641643 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.92■■■■■ 4.46
SYT6-210ENST00000641643 SMARCA4P51532 1647 aa42.28■■■■■ 4.36
SYT6-210ENST00000641643 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
SYT6-210ENST00000641643 NCAPD3P42695 1498 aa42.15■■■■■ 4.34
SYT6-210ENST00000641643 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.14■■■■■ 4.34
SYT6-210ENST00000641643 SMARCA2P51531 1590 aa42.09■■■■■ 4.33
SYT6-210ENST00000641643 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.95■■■■■ 4.31
SYT6-210ENST00000641643 HMGXB3Q12766 1538 aa41.89■■■■■ 4.3
SYT6-210ENST00000641643 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.85■■■■■ 4.29
SYT6-210ENST00000641643 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.28
SYT6-210ENST00000641643 WIZO95785 1651 aa41.47■■■■■ 4.23
SYT6-210ENST00000641643 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
SYT6-210ENST00000641643 ERCC6Q03468 1493 aa41.22■■■■■ 4.19
SYT6-210ENST00000641643 NESP48681 1621 aa41.2■■■■■ 4.19
SYT6-210ENST00000641643 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.06■■■■■ 4.16
SYT6-210ENST00000641643 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
SYT6-210ENST00000641643 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.96■■■■■ 4.15
SYT6-210ENST00000641643 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.87■■■■■ 4.13
SYT6-210ENST00000641643 CUX2O14529 1486 aa40.79■■■■■ 4.12
SYT6-210ENST00000641643 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.66■■■■■ 4.1
SYT6-210ENST00000641643 CFTRP13569 1480 aa40.63■■■■■ 4.09
SYT6-210ENST00000641643 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.59■■■■■ 4.09
SYT6-210ENST00000641643 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
SYT6-210ENST00000641643 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.47■■■■■ 4.07
SYT6-210ENST00000641643 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.44■■■■■ 4.06
SYT6-210ENST00000641643 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.42■■■■■ 4.06
SYT6-210ENST00000641643 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
SYT6-210ENST00000641643 WDR62O43379 1518 aa40.26■■■■■ 4.04
SYT6-210ENST00000641643 PRDM2Q13029 1718 aa40.2■■■■■ 4.03
SYT6-210ENST00000641643 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
SYT6-210ENST00000641643 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.85■■■■□ 3.97
SYT6-210ENST00000641643 ABCC8Q09428 1581 aa39.8■■■■□ 3.96
SYT6-210ENST00000641643 TOPBP1Q92547 1522 aa39.77■■■■□ 3.96
SYT6-210ENST00000641643 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.69■■■■□ 3.94
SYT6-210ENST00000641643 IFT140Q96RY7 1462 aa39.61■■■■□ 3.93
SYT6-210ENST00000641643 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
SYT6-210ENST00000641643 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
SYT6-210ENST00000641643 CUX1P39880 1505 aa39.36■■■■□ 3.89
SYT6-210ENST00000641643 SOGA1O94964 1423 aa39.32■■■■□ 3.88
SYT6-210ENST00000641643 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.31■■■■□ 3.88
SYT6-210ENST00000641643 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
SYT6-210ENST00000641643 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.27■■■■□ 3.88
SYT6-210ENST00000641643 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
SYT6-210ENST00000641643 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.21■■■■□ 3.87
SYT6-210ENST00000641643 OSCARQ8IYS5 282 aa39.16■■■■□ 3.86
SYT6-210ENST00000641643 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
SYT6-210ENST00000641643 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.85
SYT6-210ENST00000641643 WDR97A6NE52 1622 aa39■■■■□ 3.83
SYT6-210ENST00000641643 TOP2BQ02880 1626 aa38.96■■■■□ 3.83
SYT6-210ENST00000641643 SYNJ1O43426 1573 aa38.93■■■■□ 3.82
SYT6-210ENST00000641643 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.93■■■■□ 3.82
SYT6-210ENST00000641643 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.9■■■■□ 3.82
SYT6-210ENST00000641643 FBLN2P98095 1184 aa38.9■■■■□ 3.82
SYT6-210ENST00000641643 GRIN2BQ13224 1484 aa38.86■■■■□ 3.81
SYT6-210ENST00000641643 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.83■■■■□ 3.81
SYT6-210ENST00000641643 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.82■■■■□ 3.8
SYT6-210ENST00000641643 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
SYT6-210ENST00000641643 CHD1O14646 1710 aa38.75■■■■□ 3.79
SYT6-210ENST00000641643 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
SYT6-210ENST00000641643 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.71■■■■□ 3.79
SYT6-210ENST00000641643 PBRM1Q86U86 1689 aa38.67■■■■□ 3.78
SYT6-210ENST00000641643 SYNJ2O15056 1496 aa38.63■■■■□ 3.77
SYT6-210ENST00000641643 TRIM41Q8WV44 630 aa38.53■■■■□ 3.76
SYT6-210ENST00000641643 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.44■■■■□ 3.74
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF11O15085 1522 aa38.42■■■■□ 3.74
SYT6-210ENST00000641643 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.42■■■■□ 3.74
SYT6-210ENST00000641643 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.42■■■■□ 3.74
SYT6-210ENST00000641643 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.42■■■■□ 3.74
SYT6-210ENST00000641643 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.38■■■■□ 3.73
SYT6-210ENST00000641643 ADAMTS12P58397 1594 aa38.37■■■■□ 3.73
SYT6-210ENST00000641643 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
SYT6-210ENST00000641643 GRIN2AQ12879 1464 aa38.33■■■■□ 3.73
SYT6-210ENST00000641643 KIF27Q86VH2 1401 aa38.32■■■■□ 3.73
SYT6-210ENST00000641643 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.19■■■■□ 3.7
SYT6-210ENST00000641643 NUP160Q12769 1436 aa38.16■■■■□ 3.7
SYT6-210ENST00000641643 IGF1RP08069 1367 aa38.16■■■■□ 3.7
SYT6-210ENST00000641643 CEP170Q5SW79 1584 aa38.11■■■■□ 3.69
SYT6-210ENST00000641643 ARAP1Q96P48 1450 aa38.09■■■■□ 3.69
SYT6-210ENST00000641643 CUL7Q14999 1698 aa38.02■■■■□ 3.68
SYT6-210ENST00000641643 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.97■■■■□ 3.67
SYT6-210ENST00000641643 JPH4Q96JJ6 628 aa37.87■■■■□ 3.65
SYT6-210ENST00000641643 SHROOM2Q13796 1616 aa37.84■■■■□ 3.65
SYT6-210ENST00000641643 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.83■■■■□ 3.65
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