RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.96■■■■■ 6.39
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CCDC189-211ENST00000545825 ABCC9O60706 1549 aa47.98■■■■■ 5.27
CCDC189-211ENST00000545825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.08■■■■■ 4.97
CCDC189-211ENST00000545825 NACADO15069 1562 aa46.01■■■■■ 4.96
CCDC189-211ENST00000545825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.93■■■■■ 4.94
CCDC189-211ENST00000545825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
CCDC189-211ENST00000545825 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.71■■■■■ 4.91
CCDC189-211ENST00000545825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.47■■■■■ 4.87
CCDC189-211ENST00000545825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.04■■■■■ 4.8
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CCDC189-211ENST00000545825 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.73■■■■■ 4.75
CCDC189-211ENST00000545825 SCRIBQ14160 1630 aa44.62■■■■■ 4.73
CCDC189-211ENST00000545825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.21■■■■■ 4.67
CCDC189-211ENST00000545825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.18■■■■■ 4.66
CCDC189-211ENST00000545825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
CCDC189-211ENST00000545825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.39■■■■■ 4.54
CCDC189-211ENST00000545825 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.12■■■■■ 4.49
CCDC189-211ENST00000545825 SMARCA4P51532 1647 aa42.67■■■■■ 4.42
CCDC189-211ENST00000545825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
CCDC189-211ENST00000545825 NCAPD3P42695 1498 aa42.48■■■■■ 4.39
CCDC189-211ENST00000545825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.48■■■■■ 4.39
CCDC189-211ENST00000545825 SMARCA2P51531 1590 aa42.39■■■■■ 4.38
CCDC189-211ENST00000545825 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.37■■■■■ 4.37
CCDC189-211ENST00000545825 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.27■■■■■ 4.36
CCDC189-211ENST00000545825 HMGXB3Q12766 1538 aa42.25■■■■■ 4.35
CCDC189-211ENST00000545825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CCDC189-211ENST00000545825 WIZO95785 1651 aa41.89■■■■■ 4.3
CCDC189-211ENST00000545825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
CCDC189-211ENST00000545825 NESP48681 1621 aa41.5■■■■■ 4.23
CCDC189-211ENST00000545825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CCDC189-211ENST00000545825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.34■■■■■ 4.21
CCDC189-211ENST00000545825 ERCC6Q03468 1493 aa41.34■■■■■ 4.21
CCDC189-211ENST00000545825 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.22■■■■■ 4.19
CCDC189-211ENST00000545825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.07■■■■■ 4.16
CCDC189-211ENST00000545825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.98■■■■■ 4.15
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC189-211ENST00000545825 CFTRP13569 1480 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC189-211ENST00000545825 CUX2O14529 1486 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC189-211ENST00000545825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
CCDC189-211ENST00000545825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.75■■■■■ 4.11
CCDC189-211ENST00000545825 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.7■■■■■ 4.11
CCDC189-211ENST00000545825 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.67■■■■■ 4.1
CCDC189-211ENST00000545825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
CCDC189-211ENST00000545825 PRDM2Q13029 1718 aa40.59■■■■■ 4.09
CCDC189-211ENST00000545825 WDR62O43379 1518 aa40.56■■■■■ 4.08
CCDC189-211ENST00000545825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
CCDC189-211ENST00000545825 TOPBP1Q92547 1522 aa40.09■■■■■ 4.01
CCDC189-211ENST00000545825 ABCC8Q09428 1581 aa40.05■■■■■ 4
CCDC189-211ENST00000545825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.02■■■■■ 4
CCDC189-211ENST00000545825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.85■■■■□ 3.97
CCDC189-211ENST00000545825 IFT140Q96RY7 1462 aa39.85■■■■□ 3.97
CCDC189-211ENST00000545825 CUX1P39880 1505 aa39.75■■■■□ 3.95
CCDC189-211ENST00000545825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
CCDC189-211ENST00000545825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
CCDC189-211ENST00000545825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.63■■■■□ 3.94
CCDC189-211ENST00000545825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.57■■■■□ 3.93
CCDC189-211ENST00000545825 SOGA1O94964 1423 aa39.57■■■■□ 3.92
CCDC189-211ENST00000545825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
CCDC189-211ENST00000545825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.46■■■■□ 3.913e-6■■■■□ 22.9
CCDC189-211ENST00000545825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.44■■■■□ 3.9
CCDC189-211ENST00000545825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
CCDC189-211ENST00000545825 SYNJ1O43426 1573 aa39.37■■■■□ 3.89
CCDC189-211ENST00000545825 TOP2BQ02880 1626 aa39.36■■■■□ 3.89
CCDC189-211ENST00000545825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.36■■■■□ 3.89
CCDC189-211ENST00000545825 WDR97A6NE52 1622 aa39.31■■■■□ 3.88
CCDC189-211ENST00000545825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.24■■■■□ 3.87
CCDC189-211ENST00000545825 OSCARQ8IYS5 282 aa39.23■■■■□ 3.87
CCDC189-211ENST00000545825 GRIN2BQ13224 1484 aa39.11■■■■□ 3.85
CCDC189-211ENST00000545825 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.11■■■■□ 3.85
CCDC189-211ENST00000545825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.1■■■■□ 3.85
CCDC189-211ENST00000545825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.09■■■■□ 3.85
CCDC189-211ENST00000545825 CHD1O14646 1710 aa39.04■■■■□ 3.84
CCDC189-211ENST00000545825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
CCDC189-211ENST00000545825 PBRM1Q86U86 1689 aa39.01■■■■□ 3.84
CCDC189-211ENST00000545825 FBLN2P98095 1184 aa38.97■■■■□ 3.83
CCDC189-211ENST00000545825 SYNJ2O15056 1496 aa38.88■■■■□ 3.81
CCDC189-211ENST00000545825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
CCDC189-211ENST00000545825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.75■■■■□ 3.79
CCDC189-211ENST00000545825 ADAMTS12P58397 1594 aa38.73■■■■□ 3.79
CCDC189-211ENST00000545825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.64■■■■□ 3.78
CCDC189-211ENST00000545825 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.64■■■■□ 3.78
CCDC189-211ENST00000545825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.63■■■■□ 3.77
CCDC189-211ENST00000545825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.63■■■■□ 3.77
CCDC189-211ENST00000545825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.63■■■■□ 3.77
CCDC189-211ENST00000545825 GRIN2AQ12879 1464 aa38.62■■■■□ 3.77
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGEF11O15085 1522 aa38.62■■■■□ 3.77
CCDC189-211ENST00000545825 KIF27Q86VH2 1401 aa38.62■■■■□ 3.77
CCDC189-211ENST00000545825 IGF1RP08069 1367 aa38.49■■■■□ 3.75
CCDC189-211ENST00000545825 TRIM41Q8WV44 630 aa38.48■■■■□ 3.75
CCDC189-211ENST00000545825 NUP160Q12769 1436 aa38.46■■■■□ 3.75
CCDC189-211ENST00000545825 CEP170Q5SW79 1584 aa38.44■■■■□ 3.74
CCDC189-211ENST00000545825 CUL7Q14999 1698 aa38.36■■■■□ 3.73
CCDC189-211ENST00000545825 ARAP1Q96P48 1450 aa38.31■■■■□ 3.72
CCDC189-211ENST00000545825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.27■■■■□ 3.72
CCDC189-211ENST00000545825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.25■■■■□ 3.71
CCDC189-211ENST00000545825 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.24■■■■□ 3.71
CCDC189-211ENST00000545825 SHROOM2Q13796 1616 aa38.19■■■■□ 3.7
CCDC189-211ENST00000545825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.12■■■■□ 3.69
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