Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SREBF2Q12772 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SREBF2Q12772 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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