Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SREBF2Q12772 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SREBF2Q12772 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SREBF2Q12772 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SREBF2Q12772 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SREBF2Q12772 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SREBF2Q12772 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SREBF2Q12772 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SREBF2Q12772 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SREBF2Q12772 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SREBF2Q12772 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SREBF2Q12772 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SREBF2Q12772 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SREBF2Q12772 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SREBF2Q12772 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SREBF2Q12772 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SREBF2Q12772 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SREBF2Q12772 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SREBF2Q12772 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SREBF2Q12772 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SREBF2Q12772 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SREBF2Q12772 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SREBF2Q12772 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SREBF2Q12772 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SREBF2Q12772 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SREBF2Q12772 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SREBF2Q12772 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SREBF2Q12772 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SREBF2Q12772 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SREBF2Q12772 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SREBF2Q12772 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SREBF2Q12772 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SREBF2Q12772 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SREBF2Q12772 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SREBF2Q12772 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SREBF2Q12772 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SREBF2Q12772 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SREBF2Q12772 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SREBF2Q12772 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SREBF2Q12772 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SREBF2Q12772 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SREBF2Q12772 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SREBF2Q12772 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SREBF2Q12772 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SREBF2Q12772 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SREBF2Q12772 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SREBF2Q12772 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SREBF2Q12772 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SREBF2Q12772 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SREBF2Q12772 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SREBF2Q12772 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SREBF2Q12772 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SREBF2Q12772 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SREBF2Q12772 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SREBF2Q12772 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SREBF2Q12772 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SREBF2Q12772 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SREBF2Q12772 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SREBF2Q12772 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SREBF2Q12772 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SREBF2Q12772 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SREBF2Q12772 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SREBF2Q12772 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SREBF2Q12772 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SREBF2Q12772 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SREBF2Q12772 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SREBF2Q12772 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SREBF2Q12772 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SREBF2Q12772 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SREBF2Q12772 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SREBF2Q12772 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SREBF2Q12772 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SREBF2Q12772 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SREBF2Q12772 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SREBF2Q12772 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SREBF2Q12772 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SREBF2Q12772 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SREBF2Q12772 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SREBF2Q12772 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SREBF2Q12772 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SREBF2Q12772 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SREBF2Q12772 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SREBF2Q12772 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SREBF2Q12772 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SREBF2Q12772 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SREBF2Q12772 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SREBF2Q12772 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SREBF2Q12772 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SREBF2Q12772 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SREBF2Q12772 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SREBF2Q12772 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SREBF2Q12772 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SREBF2Q12772 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SREBF2Q12772 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SREBF2Q12772 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SREBF2Q12772 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SREBF2Q12772 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SREBF2Q12772 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SREBF2Q12772 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SREBF2Q12772 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
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