RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283006.6

CENPH-201, Transcript of centromere protein H, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPH, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPH-201ENST00000283006 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.36■■■■■ 6.29
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CENPH-201ENST00000283006 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.8■■■■■ 4.92
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CENPH-201ENST00000283006 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.65■■■■■ 4.9
CENPH-201ENST00000283006 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.31■■■■■ 4.84
CENPH-201ENST00000283006 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
CENPH-201ENST00000283006 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.99■■■■■ 4.79
CENPH-201ENST00000283006 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.6■■■■■ 4.73
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CENPH-201ENST00000283006 SCRIBQ14160 1630 aa44.16■■■■■ 4.66
CENPH-201ENST00000283006 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.05■■■■■ 4.64
CENPH-201ENST00000283006 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.97■■■■■ 4.63
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CENPH-201ENST00000283006 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.13■■■■■ 4.49
CENPH-201ENST00000283006 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.95■■■■■ 4.47
CENPH-201ENST00000283006 SMARCA4P51532 1647 aa42.22■■■■■ 4.35
CENPH-201ENST00000283006 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
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CENPH-201ENST00000283006 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.1■■■■■ 4.33
CENPH-201ENST00000283006 SMARCA2P51531 1590 aa42.07■■■■■ 4.32
CENPH-201ENST00000283006 HMGXB3Q12766 1538 aa41.9■■■■■ 4.3
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CENPH-201ENST00000283006 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
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CENPH-201ENST00000283006 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
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CENPH-201ENST00000283006 NESP48681 1621 aa41.16■■■■■ 4.18
CENPH-201ENST00000283006 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.08■■■■■ 4.17
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CENPH-201ENST00000283006 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.93■■■■■ 4.14
CENPH-201ENST00000283006 CUX2O14529 1486 aa40.89■■■■■ 4.14
CENPH-201ENST00000283006 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.88■■■■■ 4.13
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CENPH-201ENST00000283006 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.49■■■■■ 4.07
CENPH-201ENST00000283006 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.44■■■■■ 4.06
CENPH-201ENST00000283006 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.43■■■■■ 4.06
CENPH-201ENST00000283006 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.42■■■■■ 4.06
CENPH-201ENST00000283006 WDR62O43379 1518 aa40.27■■■■■ 4.04
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CENPH-201ENST00000283006 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
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CENPH-201ENST00000283006 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.24■■■■□ 3.87
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CENPH-201ENST00000283006 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.19■■■■□ 3.86
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CENPH-201ENST00000283006 WDR97A6NE52 1622 aa39.03■■■■□ 3.84
CENPH-201ENST00000283006 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.99■■■■□ 3.83
CENPH-201ENST00000283006 TOP2BQ02880 1626 aa38.89■■■■□ 3.82
CENPH-201ENST00000283006 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.86■■■■□ 3.81
CENPH-201ENST00000283006 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.86■■■■□ 3.81
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CENPH-201ENST00000283006 FBLN2P98095 1184 aa38.83■■■■□ 3.81
CENPH-201ENST00000283006 SYNJ1O43426 1573 aa38.82■■■■□ 3.81
CENPH-201ENST00000283006 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.79■■■■□ 3.8
CENPH-201ENST00000283006 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.78■■■■□ 3.8
CENPH-201ENST00000283006 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
CENPH-201ENST00000283006 CHD1O14646 1710 aa38.73■■■■□ 3.79
CENPH-201ENST00000283006 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
CENPH-201ENST00000283006 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.68■■■■□ 3.78
CENPH-201ENST00000283006 PBRM1Q86U86 1689 aa38.63■■■■□ 3.77
CENPH-201ENST00000283006 SYNJ2O15056 1496 aa38.61■■■■□ 3.77
CENPH-201ENST00000283006 TRIM41Q8WV44 630 aa38.57■■■■□ 3.76
CENPH-201ENST00000283006 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.47■■■■□ 3.75
CENPH-201ENST00000283006 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.47■■■■□ 3.75
CENPH-201ENST00000283006 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.47■■■■□ 3.75
CENPH-201ENST00000283006 ARHGEF11O15085 1522 aa38.46■■■■□ 3.75
CENPH-201ENST00000283006 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.4■■■■□ 3.74
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CENPH-201ENST00000283006 CEP170Q5SW79 1584 aa38.07■■■■□ 3.69
CENPH-201ENST00000283006 CUL7Q14999 1698 aa37.97■■■■□ 3.67
CENPH-201ENST00000283006 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.87■■■■□ 3.65
CENPH-201ENST00000283006 SHROOM2Q13796 1616 aa37.85■■■■□ 3.65
CENPH-201ENST00000283006 JPH4Q96JJ6 628 aa37.81■■■■□ 3.64
CENPH-201ENST00000283006 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.78■■■■□ 3.64
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