Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD3Q9Y3P4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDD3Q9Y3P4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDD3Q9Y3P4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDD3Q9Y3P4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDD3Q9Y3P4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDD3Q9Y3P4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDD3Q9Y3P4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDD3Q9Y3P4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDD3Q9Y3P4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD3Q9Y3P4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDD3Q9Y3P4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDD3Q9Y3P4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD3Q9Y3P4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDD3Q9Y3P4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD3Q9Y3P4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD3Q9Y3P4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD3Q9Y3P4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD3Q9Y3P4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD3Q9Y3P4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD3Q9Y3P4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD3Q9Y3P4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD3Q9Y3P4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHBDD3Q9Y3P4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDD3Q9Y3P4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD3Q9Y3P4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD3Q9Y3P4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD3Q9Y3P4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD3Q9Y3P4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD3Q9Y3P4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD3Q9Y3P4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD3Q9Y3P4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD3Q9Y3P4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD3Q9Y3P4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD3Q9Y3P4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD3Q9Y3P4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD3Q9Y3P4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms