Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT52Q9Y366 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT52Q9Y366 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT52Q9Y366 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT52Q9Y366 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT52Q9Y366 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT52Q9Y366 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT52Q9Y366 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT52Q9Y366 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT52Q9Y366 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT52Q9Y366 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IFT52Q9Y366 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT52Q9Y366 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT52Q9Y366 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT52Q9Y366 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT52Q9Y366 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT52Q9Y366 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT52Q9Y366 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT52Q9Y366 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
IFT52Q9Y366 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT52Q9Y366 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT52Q9Y366 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT52Q9Y366 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT52Q9Y366 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT52Q9Y366 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT52Q9Y366 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT52Q9Y366 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT52Q9Y366 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT52Q9Y366 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT52Q9Y366 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT52Q9Y366 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT52Q9Y366 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT52Q9Y366 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT52Q9Y366 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT52Q9Y366 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT52Q9Y366 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT52Q9Y366 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT52Q9Y366 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT52Q9Y366 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms