Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT11Q9UKZ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT11Q9UKZ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT11Q9UKZ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNOT11Q9UKZ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT11Q9UKZ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNOT11Q9UKZ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNOT11Q9UKZ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNOT11Q9UKZ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNOT11Q9UKZ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNOT11Q9UKZ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT11Q9UKZ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT11Q9UKZ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT11Q9UKZ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT11Q9UKZ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT11Q9UKZ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT11Q9UKZ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT11Q9UKZ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT11Q9UKZ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNOT11Q9UKZ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT11Q9UKZ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT11Q9UKZ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT11Q9UKZ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT11Q9UKZ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT11Q9UKZ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT11Q9UKZ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT11Q9UKZ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT11Q9UKZ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT11Q9UKZ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT11Q9UKZ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT11Q9UKZ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT11Q9UKZ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT11Q9UKZ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT11Q9UKZ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT11Q9UKZ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT11Q9UKZ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT11Q9UKZ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT11Q9UKZ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT11Q9UKZ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT11Q9UKZ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT11Q9UKZ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT11Q9UKZ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT11Q9UKZ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNOT11Q9UKZ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT11Q9UKZ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT11Q9UKZ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT11Q9UKZ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT11Q9UKZ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT11Q9UKZ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT11Q9UKZ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT11Q9UKZ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNOT11Q9UKZ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT11Q9UKZ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT11Q9UKZ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT11Q9UKZ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT11Q9UKZ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNOT11Q9UKZ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNOT11Q9UKZ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms