Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP50Q9UKX7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP50Q9UKX7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP50Q9UKX7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP50Q9UKX7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP50Q9UKX7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP50Q9UKX7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP50Q9UKX7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP50Q9UKX7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP50Q9UKX7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP50Q9UKX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP50Q9UKX7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP50Q9UKX7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP50Q9UKX7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP50Q9UKX7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP50Q9UKX7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP50Q9UKX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP50Q9UKX7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP50Q9UKX7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP50Q9UKX7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP50Q9UKX7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP50Q9UKX7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP50Q9UKX7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP50Q9UKX7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP50Q9UKX7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP50Q9UKX7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP50Q9UKX7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP50Q9UKX7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP50Q9UKX7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP50Q9UKX7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP50Q9UKX7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP50Q9UKX7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP50Q9UKX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP50Q9UKX7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP50Q9UKX7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP50Q9UKX7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP50Q9UKX7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP50Q9UKX7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP50Q9UKX7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP50Q9UKX7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP50Q9UKX7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP50Q9UKX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP50Q9UKX7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP50Q9UKX7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms