Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP50Q9UKX7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP50Q9UKX7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP50Q9UKX7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP50Q9UKX7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP50Q9UKX7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP50Q9UKX7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP50Q9UKX7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP50Q9UKX7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP50Q9UKX7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP50Q9UKX7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP50Q9UKX7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP50Q9UKX7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP50Q9UKX7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP50Q9UKX7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP50Q9UKX7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP50Q9UKX7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP50Q9UKX7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP50Q9UKX7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP50Q9UKX7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP50Q9UKX7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP50Q9UKX7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP50Q9UKX7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP50Q9UKX7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP50Q9UKX7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP50Q9UKX7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP50Q9UKX7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP50Q9UKX7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP50Q9UKX7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP50Q9UKX7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP50Q9UKX7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP50Q9UKX7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP50Q9UKX7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP50Q9UKX7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP50Q9UKX7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP50Q9UKX7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP50Q9UKX7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP50Q9UKX7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP50Q9UKX7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP50Q9UKX7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP50Q9UKX7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP50Q9UKX7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP50Q9UKX7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP50Q9UKX7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP50Q9UKX7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP50Q9UKX7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP50Q9UKX7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP50Q9UKX7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP50Q9UKX7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP50Q9UKX7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP50Q9UKX7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP50Q9UKX7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP50Q9UKX7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP50Q9UKX7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP50Q9UKX7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP50Q9UKX7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP50Q9UKX7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP50Q9UKX7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP50Q9UKX7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP50Q9UKX7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP50Q9UKX7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP50Q9UKX7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP50Q9UKX7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP50Q9UKX7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP50Q9UKX7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP50Q9UKX7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP50Q9UKX7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP50Q9UKX7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP50Q9UKX7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP50Q9UKX7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP50Q9UKX7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP50Q9UKX7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP50Q9UKX7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP50Q9UKX7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP50Q9UKX7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP50Q9UKX7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP50Q9UKX7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP50Q9UKX7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP50Q9UKX7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP50Q9UKX7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP50Q9UKX7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP50Q9UKX7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP50Q9UKX7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP50Q9UKX7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP50Q9UKX7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP50Q9UKX7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP50Q9UKX7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP50Q9UKX7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP50Q9UKX7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP50Q9UKX7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP50Q9UKX7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP50Q9UKX7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP50Q9UKX7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP50Q9UKX7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP50Q9UKX7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP50Q9UKX7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP50Q9UKX7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP50Q9UKX7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP50Q9UKX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP50Q9UKX7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms