Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNIH4Q9P003 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNIH4Q9P003 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNIH4Q9P003 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNIH4Q9P003 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNIH4Q9P003 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNIH4Q9P003 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNIH4Q9P003 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNIH4Q9P003 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNIH4Q9P003 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNIH4Q9P003 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNIH4Q9P003 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNIH4Q9P003 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNIH4Q9P003 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNIH4Q9P003 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNIH4Q9P003 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNIH4Q9P003 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNIH4Q9P003 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNIH4Q9P003 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNIH4Q9P003 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNIH4Q9P003 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNIH4Q9P003 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNIH4Q9P003 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNIH4Q9P003 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNIH4Q9P003 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNIH4Q9P003 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNIH4Q9P003 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNIH4Q9P003 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNIH4Q9P003 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNIH4Q9P003 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNIH4Q9P003 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNIH4Q9P003 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNIH4Q9P003 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNIH4Q9P003 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNIH4Q9P003 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNIH4Q9P003 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNIH4Q9P003 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNIH4Q9P003 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNIH4Q9P003 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNIH4Q9P003 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNIH4Q9P003 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNIH4Q9P003 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms