Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3EQ9NVU0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3EQ9NVU0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3EQ9NVU0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3EQ9NVU0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR3EQ9NVU0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR3EQ9NVU0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR3EQ9NVU0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR3EQ9NVU0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR3EQ9NVU0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR3EQ9NVU0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR3EQ9NVU0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLR3EQ9NVU0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR3EQ9NVU0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR3EQ9NVU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR3EQ9NVU0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR3EQ9NVU0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
POLR3EQ9NVU0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
POLR3EQ9NVU0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR3EQ9NVU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR3EQ9NVU0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR3EQ9NVU0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3EQ9NVU0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3EQ9NVU0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR3EQ9NVU0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR3EQ9NVU0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR3EQ9NVU0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR3EQ9NVU0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
POLR3EQ9NVU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3EQ9NVU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3EQ9NVU0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3EQ9NVU0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR3EQ9NVU0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR3EQ9NVU0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
POLR3EQ9NVU0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLR3EQ9NVU0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLR3EQ9NVU0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR3EQ9NVU0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR3EQ9NVU0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR3EQ9NVU0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR3EQ9NVU0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR3EQ9NVU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR3EQ9NVU0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR3EQ9NVU0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR3EQ9NVU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3EQ9NVU0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3EQ9NVU0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR3EQ9NVU0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3EQ9NVU0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR3EQ9NVU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLR3EQ9NVU0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR3EQ9NVU0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR3EQ9NVU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR3EQ9NVU0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR3EQ9NVU0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR3EQ9NVU0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR3EQ9NVU0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR3EQ9NVU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR3EQ9NVU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR3EQ9NVU0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR3EQ9NVU0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR3EQ9NVU0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLR3EQ9NVU0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR3EQ9NVU0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR3EQ9NVU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR3EQ9NVU0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR3EQ9NVU0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3EQ9NVU0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3EQ9NVU0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR3EQ9NVU0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR3EQ9NVU0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3EQ9NVU0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR3EQ9NVU0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR3EQ9NVU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms