Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAR1AQ9NR31 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAR1AQ9NR31 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAR1AQ9NR31 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAR1AQ9NR31 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAR1AQ9NR31 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAR1AQ9NR31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAR1AQ9NR31 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAR1AQ9NR31 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAR1AQ9NR31 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAR1AQ9NR31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAR1AQ9NR31 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAR1AQ9NR31 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAR1AQ9NR31 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAR1AQ9NR31 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAR1AQ9NR31 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAR1AQ9NR31 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAR1AQ9NR31 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAR1AQ9NR31 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAR1AQ9NR31 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAR1AQ9NR31 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAR1AQ9NR31 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAR1AQ9NR31 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAR1AQ9NR31 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAR1AQ9NR31 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAR1AQ9NR31 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAR1AQ9NR31 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAR1AQ9NR31 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAR1AQ9NR31 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAR1AQ9NR31 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAR1AQ9NR31 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAR1AQ9NR31 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAR1AQ9NR31 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SAR1AQ9NR31 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SAR1AQ9NR31 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAR1AQ9NR31 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SAR1AQ9NR31 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAR1AQ9NR31 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAR1AQ9NR31 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SAR1AQ9NR31 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SAR1AQ9NR31 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SAR1AQ9NR31 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAR1AQ9NR31 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAR1AQ9NR31 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAR1AQ9NR31 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAR1AQ9NR31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAR1AQ9NR31 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAR1AQ9NR31 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAR1AQ9NR31 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAR1AQ9NR31 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAR1AQ9NR31 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAR1AQ9NR31 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAR1AQ9NR31 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAR1AQ9NR31 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAR1AQ9NR31 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAR1AQ9NR31 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SAR1AQ9NR31 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAR1AQ9NR31 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAR1AQ9NR31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAR1AQ9NR31 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAR1AQ9NR31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAR1AQ9NR31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAR1AQ9NR31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAR1AQ9NR31 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAR1AQ9NR31 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAR1AQ9NR31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAR1AQ9NR31 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAR1AQ9NR31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAR1AQ9NR31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAR1AQ9NR31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAR1AQ9NR31 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAR1AQ9NR31 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAR1AQ9NR31 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAR1AQ9NR31 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAR1AQ9NR31 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAR1AQ9NR31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAR1AQ9NR31 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms