Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SAR1AQ9NR31 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SAR1AQ9NR31 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SAR1AQ9NR31 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SAR1AQ9NR31 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SAR1AQ9NR31 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SAR1AQ9NR31 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SAR1AQ9NR31 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SAR1AQ9NR31 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SAR1AQ9NR31 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SAR1AQ9NR31 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SAR1AQ9NR31 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SAR1AQ9NR31 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SAR1AQ9NR31 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SAR1AQ9NR31 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SAR1AQ9NR31 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SAR1AQ9NR31 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SAR1AQ9NR31 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SAR1AQ9NR31 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SAR1AQ9NR31 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAR1AQ9NR31 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SAR1AQ9NR31 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SAR1AQ9NR31 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SAR1AQ9NR31 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SAR1AQ9NR31 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SAR1AQ9NR31 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SAR1AQ9NR31 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SAR1AQ9NR31 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SAR1AQ9NR31 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAR1AQ9NR31 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SAR1AQ9NR31 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SAR1AQ9NR31 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SAR1AQ9NR31 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SAR1AQ9NR31 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAR1AQ9NR31 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SAR1AQ9NR31 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAR1AQ9NR31 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SAR1AQ9NR31 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SAR1AQ9NR31 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SAR1AQ9NR31 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAR1AQ9NR31 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SAR1AQ9NR31 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SAR1AQ9NR31 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAR1AQ9NR31 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAR1AQ9NR31 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAR1AQ9NR31 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAR1AQ9NR31 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SAR1AQ9NR31 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SAR1AQ9NR31 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAR1AQ9NR31 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAR1AQ9NR31 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAR1AQ9NR31 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SAR1AQ9NR31 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SAR1AQ9NR31 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SAR1AQ9NR31 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SAR1AQ9NR31 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAR1AQ9NR31 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAR1AQ9NR31 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SAR1AQ9NR31 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAR1AQ9NR31 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SAR1AQ9NR31 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SAR1AQ9NR31 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAR1AQ9NR31 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SAR1AQ9NR31 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAR1AQ9NR31 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAR1AQ9NR31 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAR1AQ9NR31 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAR1AQ9NR31 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAR1AQ9NR31 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAR1AQ9NR31 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAR1AQ9NR31 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAR1AQ9NR31 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAR1AQ9NR31 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAR1AQ9NR31 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAR1AQ9NR31 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAR1AQ9NR31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAR1AQ9NR31 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAR1AQ9NR31 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAR1AQ9NR31 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAR1AQ9NR31 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAR1AQ9NR31 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAR1AQ9NR31 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAR1AQ9NR31 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SAR1AQ9NR31 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAR1AQ9NR31 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAR1AQ9NR31 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAR1AQ9NR31 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SAR1AQ9NR31 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SAR1AQ9NR31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAR1AQ9NR31 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAR1AQ9NR31 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAR1AQ9NR31 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAR1AQ9NR31 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAR1AQ9NR31 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAR1AQ9NR31 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAR1AQ9NR31 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAR1AQ9NR31 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAR1AQ9NR31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAR1AQ9NR31 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAR1AQ9NR31 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms