Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN8

SDF2L1, Stromal cell-derived factor 2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2L1Q9HCN8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2L1Q9HCN8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2L1Q9HCN8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2L1Q9HCN8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDF2L1Q9HCN8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDF2L1Q9HCN8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2L1Q9HCN8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDF2L1Q9HCN8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2L1Q9HCN8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2L1Q9HCN8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDF2L1Q9HCN8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDF2L1Q9HCN8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDF2L1Q9HCN8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDF2L1Q9HCN8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2L1Q9HCN8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2L1Q9HCN8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2L1Q9HCN8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDF2L1Q9HCN8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2L1Q9HCN8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF2L1Q9HCN8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2L1Q9HCN8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF2L1Q9HCN8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF2L1Q9HCN8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2L1Q9HCN8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF2L1Q9HCN8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF2L1Q9HCN8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF2L1Q9HCN8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2L1Q9HCN8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2L1Q9HCN8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF2L1Q9HCN8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF2L1Q9HCN8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF2L1Q9HCN8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDF2L1Q9HCN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SDF2L1Q9HCN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2L1Q9HCN8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2L1Q9HCN8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2L1Q9HCN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2L1Q9HCN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF2L1Q9HCN8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2L1Q9HCN8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF2L1Q9HCN8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2L1Q9HCN8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2L1Q9HCN8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2L1Q9HCN8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2L1Q9HCN8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF2L1Q9HCN8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF2L1Q9HCN8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2L1Q9HCN8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF2L1Q9HCN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2L1Q9HCN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2L1Q9HCN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2L1Q9HCN8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDF2L1Q9HCN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDF2L1Q9HCN8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDF2L1Q9HCN8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2L1Q9HCN8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2L1Q9HCN8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2L1Q9HCN8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2L1Q9HCN8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDF2L1Q9HCN8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDF2L1Q9HCN8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDF2L1Q9HCN8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDF2L1Q9HCN8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDF2L1Q9HCN8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDF2L1Q9HCN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDF2L1Q9HCN8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDF2L1Q9HCN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms