Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMURF1Q9HCE7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMURF1Q9HCE7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMURF1Q9HCE7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMURF1Q9HCE7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMURF1Q9HCE7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMURF1Q9HCE7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMURF1Q9HCE7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMURF1Q9HCE7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMURF1Q9HCE7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMURF1Q9HCE7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMURF1Q9HCE7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMURF1Q9HCE7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMURF1Q9HCE7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMURF1Q9HCE7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMURF1Q9HCE7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMURF1Q9HCE7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMURF1Q9HCE7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMURF1Q9HCE7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMURF1Q9HCE7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMURF1Q9HCE7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMURF1Q9HCE7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMURF1Q9HCE7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMURF1Q9HCE7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMURF1Q9HCE7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMURF1Q9HCE7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMURF1Q9HCE7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMURF1Q9HCE7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMURF1Q9HCE7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMURF1Q9HCE7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMURF1Q9HCE7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMURF1Q9HCE7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMURF1Q9HCE7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMURF1Q9HCE7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMURF1Q9HCE7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMURF1Q9HCE7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMURF1Q9HCE7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMURF1Q9HCE7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMURF1Q9HCE7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMURF1Q9HCE7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMURF1Q9HCE7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMURF1Q9HCE7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMURF1Q9HCE7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMURF1Q9HCE7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMURF1Q9HCE7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMURF1Q9HCE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMURF1Q9HCE7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMURF1Q9HCE7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMURF1Q9HCE7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMURF1Q9HCE7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMURF1Q9HCE7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms