Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDH9Q9HC56 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDH9Q9HC56 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDH9Q9HC56 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDH9Q9HC56 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCDH9Q9HC56 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCDH9Q9HC56 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PCDH9Q9HC56 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PCDH9Q9HC56 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PCDH9Q9HC56 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDH9Q9HC56 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDH9Q9HC56 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDH9Q9HC56 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDH9Q9HC56 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDH9Q9HC56 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDH9Q9HC56 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDH9Q9HC56 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDH9Q9HC56 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDH9Q9HC56 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDH9Q9HC56 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDH9Q9HC56 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDH9Q9HC56 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDH9Q9HC56 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDH9Q9HC56 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDH9Q9HC56 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDH9Q9HC56 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDH9Q9HC56 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDH9Q9HC56 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDH9Q9HC56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDH9Q9HC56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDH9Q9HC56 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDH9Q9HC56 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCDH9Q9HC56 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDH9Q9HC56 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDH9Q9HC56 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDH9Q9HC56 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDH9Q9HC56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDH9Q9HC56 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCDH9Q9HC56 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDH9Q9HC56 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDH9Q9HC56 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDH9Q9HC56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDH9Q9HC56 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDH9Q9HC56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDH9Q9HC56 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDH9Q9HC56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDH9Q9HC56 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDH9Q9HC56 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDH9Q9HC56 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDH9Q9HC56 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDH9Q9HC56 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDH9Q9HC56 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDH9Q9HC56 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDH9Q9HC56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDH9Q9HC56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDH9Q9HC56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms