Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VCX3BQ9H321 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCX3BQ9H321 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCX3BQ9H321 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCX3BQ9H321 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCX3BQ9H321 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCX3BQ9H321 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCX3BQ9H321 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCX3BQ9H321 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCX3BQ9H321 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCX3BQ9H321 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCX3BQ9H321 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VCX3BQ9H321 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCX3BQ9H321 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCX3BQ9H321 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VCX3BQ9H321 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VCX3BQ9H321 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCX3BQ9H321 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCX3BQ9H321 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VCX3BQ9H321 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCX3BQ9H321 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCX3BQ9H321 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCX3BQ9H321 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VCX3BQ9H321 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCX3BQ9H321 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCX3BQ9H321 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCX3BQ9H321 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCX3BQ9H321 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCX3BQ9H321 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCX3BQ9H321 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCX3BQ9H321 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCX3BQ9H321 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCX3BQ9H321 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCX3BQ9H321 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCX3BQ9H321 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VCX3BQ9H321 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCX3BQ9H321 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCX3BQ9H321 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCX3BQ9H321 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCX3BQ9H321 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCX3BQ9H321 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCX3BQ9H321 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCX3BQ9H321 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCX3BQ9H321 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCX3BQ9H321 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCX3BQ9H321 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCX3BQ9H321 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCX3BQ9H321 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCX3BQ9H321 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCX3BQ9H321 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCX3BQ9H321 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCX3BQ9H321 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VCX3BQ9H321 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCX3BQ9H321 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCX3BQ9H321 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCX3BQ9H321 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCX3BQ9H321 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCX3BQ9H321 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCX3BQ9H321 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCX3BQ9H321 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCX3BQ9H321 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCX3BQ9H321 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCX3BQ9H321 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCX3BQ9H321 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCX3BQ9H321 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VCX3BQ9H321 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCX3BQ9H321 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCX3BQ9H321 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCX3BQ9H321 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCX3BQ9H321 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCX3BQ9H321 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCX3BQ9H321 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCX3BQ9H321 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCX3BQ9H321 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCX3BQ9H321 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCX3BQ9H321 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCX3BQ9H321 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCX3BQ9H321 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms