Protein–RNA interactions for Protein: Q9H161

ALX4, Homeobox protein aristaless-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX4Q9H161 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX4Q9H161 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX4Q9H161 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX4Q9H161 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX4Q9H161 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX4Q9H161 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALX4Q9H161 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX4Q9H161 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX4Q9H161 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX4Q9H161 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX4Q9H161 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX4Q9H161 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX4Q9H161 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX4Q9H161 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX4Q9H161 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX4Q9H161 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX4Q9H161 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX4Q9H161 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX4Q9H161 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX4Q9H161 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX4Q9H161 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX4Q9H161 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX4Q9H161 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX4Q9H161 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALX4Q9H161 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX4Q9H161 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX4Q9H161 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX4Q9H161 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX4Q9H161 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX4Q9H161 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX4Q9H161 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX4Q9H161 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX4Q9H161 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX4Q9H161 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX4Q9H161 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX4Q9H161 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX4Q9H161 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX4Q9H161 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX4Q9H161 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX4Q9H161 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX4Q9H161 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX4Q9H161 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX4Q9H161 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX4Q9H161 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX4Q9H161 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX4Q9H161 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX4Q9H161 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX4Q9H161 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX4Q9H161 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALX4Q9H161 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX4Q9H161 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX4Q9H161 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX4Q9H161 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX4Q9H161 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX4Q9H161 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALX4Q9H161 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX4Q9H161 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX4Q9H161 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX4Q9H161 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX4Q9H161 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX4Q9H161 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX4Q9H161 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX4Q9H161 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX4Q9H161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX4Q9H161 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX4Q9H161 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX4Q9H161 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms