Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL8

PDCD10, Programmed cell death protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD10Q9BUL8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD10Q9BUL8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD10Q9BUL8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD10Q9BUL8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD10Q9BUL8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD10Q9BUL8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD10Q9BUL8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD10Q9BUL8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD10Q9BUL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD10Q9BUL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD10Q9BUL8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD10Q9BUL8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD10Q9BUL8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD10Q9BUL8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD10Q9BUL8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD10Q9BUL8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD10Q9BUL8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD10Q9BUL8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD10Q9BUL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD10Q9BUL8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD10Q9BUL8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCD10Q9BUL8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD10Q9BUL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD10Q9BUL8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD10Q9BUL8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD10Q9BUL8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD10Q9BUL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDCD10Q9BUL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCD10Q9BUL8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCD10Q9BUL8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD10Q9BUL8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD10Q9BUL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD10Q9BUL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD10Q9BUL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD10Q9BUL8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD10Q9BUL8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD10Q9BUL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD10Q9BUL8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD10Q9BUL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD10Q9BUL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD10Q9BUL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD10Q9BUL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD10Q9BUL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD10Q9BUL8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD10Q9BUL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD10Q9BUL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD10Q9BUL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD10Q9BUL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD10Q9BUL8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD10Q9BUL8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD10Q9BUL8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD10Q9BUL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD10Q9BUL8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD10Q9BUL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms