Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG101Q9BSB4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG101Q9BSB4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG101Q9BSB4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG101Q9BSB4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG101Q9BSB4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG101Q9BSB4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG101Q9BSB4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG101Q9BSB4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG101Q9BSB4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG101Q9BSB4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG101Q9BSB4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG101Q9BSB4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG101Q9BSB4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG101Q9BSB4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG101Q9BSB4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG101Q9BSB4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG101Q9BSB4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG101Q9BSB4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG101Q9BSB4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG101Q9BSB4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG101Q9BSB4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG101Q9BSB4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG101Q9BSB4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG101Q9BSB4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG101Q9BSB4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG101Q9BSB4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG101Q9BSB4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG101Q9BSB4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG101Q9BSB4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG101Q9BSB4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG101Q9BSB4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG101Q9BSB4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms