Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LITAFQ99732 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LITAFQ99732 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LITAFQ99732 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LITAFQ99732 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LITAFQ99732 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LITAFQ99732 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LITAFQ99732 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LITAFQ99732 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LITAFQ99732 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LITAFQ99732 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LITAFQ99732 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LITAFQ99732 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LITAFQ99732 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LITAFQ99732 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LITAFQ99732 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LITAFQ99732 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LITAFQ99732 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LITAFQ99732 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LITAFQ99732 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LITAFQ99732 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LITAFQ99732 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LITAFQ99732 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LITAFQ99732 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LITAFQ99732 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LITAFQ99732 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LITAFQ99732 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LITAFQ99732 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
LITAFQ99732 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LITAFQ99732 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LITAFQ99732 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LITAFQ99732 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LITAFQ99732 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LITAFQ99732 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LITAFQ99732 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LITAFQ99732 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms