Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PANX3Q96QZ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANX3Q96QZ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PANX3Q96QZ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PANX3Q96QZ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PANX3Q96QZ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANX3Q96QZ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANX3Q96QZ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANX3Q96QZ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PANX3Q96QZ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PANX3Q96QZ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PANX3Q96QZ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PANX3Q96QZ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PANX3Q96QZ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PANX3Q96QZ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PANX3Q96QZ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PANX3Q96QZ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PANX3Q96QZ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PANX3Q96QZ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PANX3Q96QZ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PANX3Q96QZ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PANX3Q96QZ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANX3Q96QZ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANX3Q96QZ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANX3Q96QZ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANX3Q96QZ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANX3Q96QZ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANX3Q96QZ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PANX3Q96QZ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PANX3Q96QZ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANX3Q96QZ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANX3Q96QZ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PANX3Q96QZ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PANX3Q96QZ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PANX3Q96QZ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PANX3Q96QZ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PANX3Q96QZ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PANX3Q96QZ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PANX3Q96QZ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PANX3Q96QZ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PANX3Q96QZ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PANX3Q96QZ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PANX3Q96QZ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PANX3Q96QZ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PANX3Q96QZ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PANX3Q96QZ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PANX3Q96QZ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PANX3Q96QZ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PANX3Q96QZ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PANX3Q96QZ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PANX3Q96QZ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PANX3Q96QZ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PANX3Q96QZ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PANX3Q96QZ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PANX3Q96QZ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PANX3Q96QZ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PANX3Q96QZ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PANX3Q96QZ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.3 ms